25 Şubat 2009 Çarşamba

Genel Mikrobiyoloji Deneme

Ara sınav soruları –

1)Organik maddelere ihtiyaç göstermeyen mikroorganizmalara ne ad verilir?

a)kemoototrof
b)heterotrof
c)ototrof
d)kemoheterotrof
e)fotoototrof

2)Isıyı seven ve yüksek derecede ısıda üreyebilen bakteriler aşağıdaki,lerden hangisidir?
a)mezofil bakteriler
b)p s i krofil bakteriler
c)fakültatif bakteriler
d)aerofil bakteriler
e) termofil bakreiler

3)Hangisi buyyona agar eklemekle elde edilen basit besiyeridir?

a)lugol b)jeloz c)nükleus d) primer e)kolitsin

4)Aşağıdakilerden hangisi besiyerinin sterilizasyonunda kullanılır?

a)soğutma b)eküvyon c)benmarj d) otoklav e)santrifüj

5)Preparat ile objektif içerisindeki bir nokta arasındaki uzaklığa ne denir?

a)fokal uzunluk b)çalışma mesafesi c)numerik aralık d) ayırım mesafesi e)lam uzunluğu

6)Kuru ,sıcak hava ile sterilizasyon sağlayan ve elektrik enerjisini ısı enerjisine çeviren araç nedir?

a)etüv b) otoklav c) santrifüj d) petri kutusu e)sterilizastör

7)Havayı önce HEPA filtrelerinden geçirip sonra kabın içerisine gönderen güvenlik kabı nedir?

a)sınıf 3 güvenlik kabı b) sınıf 4 güvenlik kabı c) sınıf 2 güvenlik kabı
d)sınıf 1 güvenlik kabı
e)wyvıı güvenlik kabı

8)Aşağıdakilerden hangisi çeşitli dalga boylarındaki ışığın bir ortamdan geçirilirken şiddetindeki azalmayı ölçen alettir?

a)eküvyon b) spektrofotometre c) etüv d) öze e) santrifüj

9)Genlerin kapyalarını dna dan mrna ya aktaran nedir?

a)translation b)transformasyon c) transdüksiyon d)transcripsiyon e) konjugasyon

10) Aşağıdakilerden hangisi genin dna daki yerine verilen addır?

a)lokus b)operon c)nüklosid d) ligaz e) prob

11)Hangisi beta-laktom grunu anti mikrobikleri arasında yer almaz?

a)penisilin b)sefalosporin c)karbenepem d)monobaktem e)vankomisin

12)Aşağıdakilerden hangisi kültür ortamında standart şartlarda bakterilerin neredeyse tamamını öldüren en düşük ilaç konsantrasyonudur?

a)mik b)terapötik indeks c)bakterisid ilaçlar d)mbk e)bakteriyostatik ilaçlar

13)nitriti nitrarta çeviren nedir?

a)co b)nitro bakteriler c)azot bakterileri d)aminoasitler e)nitrosomonas bakteriler

14)serumlarda bulunan ve çeşitli hastalıklara karşı oluşmuş antikorlar ne ile araştırılır?

a)deney hayvanı inokulasyonu b) kültür c) serolojik test d) mikroskopi e)besiyeri örneği

15)hangisi lipazlarla proteinleri parçalayan bakteri türleri arasında değildir?

a)alcaligenez b) streptococcus c)koliform d9mastit e)mukoza

16)sulu ışkı örneği parazit açısından en geç ne kadar süre içinde incelenmelidir?

a)2 saat b)1 saat c)90 dakika d)5 dakika e)30 dakika

17)dna yapısı kaç yılı9nda ortaya çıktı?

a)1960 b)1942 c)1965 d)1953 e)1938

18)hangisi prokaryot özelliği değildir?

a)prokaryot hücrede çekirdek yoktur
b)endoplazmik retikulumu prokaryotta bulunmaz
c)prokartyottaki ribozom ökaryottakinden büyüktür
d)prokaryotta mitotik bölünme olmaz
e)sterol taşımazlar

19)bir tarafın yararına diğer tarafın zarar görmesine neden olan konak mikrop çevre ilişkisine ne denir?

a)simbiyoz b) kommensal c) parazitlik d)patojen e) virulans

20)elementer cisimleri 0,2-1 mikron ,retiküler cisimleri 1 mikron olan zorunlu hücre içi paraziti nedir?

a)klamidyalar b) mikoplazma c)riketsiyalar d) poxviruslar e)herpesvirus

21)dışkı preparatı üstüne damlatılan lugol solisyonu sonrası parazit yumurtaları hangi rengi alır?

a)koyu vişne b)mavi-kırmızı c)mor d) sarı-kahverengi e)yeşil

22)alınan besin maddelerinin yaklılıp enerji çıkmasına ne denir?

a)metabolizma b)mikroorganizma c9katabolizma d)anabolizma e)subroisra

23)üreyebilmeleri için oratamda o2 azalmasına ihtiyaç duyan mikroorganizmalar nelerdir?

a)mikroaerofilikb)aerobik c) fakültatif d)nanoaerobik e)anaeorobik

24)hangisi insanlarda hastalık yapma özelliğinden dolayı mikropların ortamdan uzaklaştırılma sistemidir?

a)sterilzasyon b)antisepsi c)pastörizasyon d)dezenfeksiyon e)dezenfektan

25)hangisi oraganik bir çözücüdür?

a)sabun b)yağ asiti c)benzal konium klorür d)krezol e)kloroform

26)kadavra ve dokuların saklanmasında ne kullanılır?

a)okside edici madde b)alkilleyici madde c)ağır metal tuzları d)metilen mavisi e)fuksin

27) deri antisepsisi için ne kullanılır?

A)sabun b)gaz plazma c)iyot tentürü d)gama radyasyonu e)x ışını

28)hangisi yeni doğan bebeklerde göz antisepsisi için kullanılır*

A)gümüş nitran b)ozon c)klor d)formalin e)aktirin


Cevaplar .1-c 2-e 3-b 4-d 5-a 6-e 7-c 8-b 9-d 10-a 11-e 12 –d 13-b 14-c 15-a 16-e 17-d 18-c 19-b 20-a 21-d 22-c 23a-a 24-d 25-e 26-b 27-c 28-a

Adaptasyon

Adaptasyon
Bitkilerdeki dokular bitkilere göre bir takım farklılıklar gösterir. Bitkilerin yaşam ortamındaki çevresel koşullar
gelişmişliği ait olduğu dokularda farklılaşmaların oluşmasına neden olur. ÖRNEK: Kurak bölge bitkisinde
1-Gövde kısa ve kalın.
2-Kök çok gelişmiş.
3-Yaprak kalın ve küçük yüzeyli.
4-Gözenek (stoma) az ve derinde.
5-Yaprak yüzeyi terlemeyi önleyen fazla ışığı engelleyen tüylerle çevrilidir.
Epidermisin dış çeperi daha kalındır.
6-Kutiküla Kalınlaşmıştır.
Monokotil ve Dikotil Canlıların Karşılaştırılması.
Organ-Yapı Monokotil Dikotil
Kök : Saçak Kazık
Yaprak : Perdeli damar Ağsı damar
Tohum : Tek çenek Çift çenek
letim demeti : Dağınık (Kapalı) Düzenli sıralanış
Meristem doku : Pirimer meristem Pirimer ve sekonder meristem var
Büyüme : Boyca Boyca ve ence
Bitkilerde Analoji : Farklı orijine sahip yapıların metamorfozla aynı işi yapabilecek karakterlerle donanması.
Çiçeksiz bitkilerde = Rizoid ler , Parazit bitkilerde = Haustorium-emeçler ,Yüksek bitkilerde = Kökler
Bitkilerde homoloji : Yaprak = Stamen = Karpeller : Bunların kökenleri aynı ancak farklı görevleri
gerçekleştirmek için metamorfozla morfoloji ,histolojik ve anatomik farklılıklar gösterir.
A-Kök :
lk kök sistemi eğreltilerde görülür. Karayosunlarındaki rizoid ler kök görevi üstlenen analog yapılardır.
Kökün Temel Özellikleri:
1-Su ve mineral alınmasına organize olmuştur.
2-Yer çekimine pozitif tropizma yaparlar.
3-Yaprak taşımazlar.
4-Klorofil içermezler.
5-Epidermis i ince çeperlidir.
6-Stoma ve tüy metamorfozları taşımaz.
7-Epidermis ten emici tüyler oluşur ve büyük tek koful taşırlar.
8-Dış çeperde (epidermis) kütikula bulunmaz.
Kök Metamorfozları :
1-Depo Kökler : Şişkin ve depo organı özelliğinde olup besin depolar. ÖRN: Havuçta nişasta , Pancarda
şeker birikir.
2-Tutunma Kökleri : Duvar ve diğer cisimlere tutunmada rol oynarlar. Haptotropik (dokunmaya yönelme)
tepki verirler. ÖRNuvar sarmaşığı.
3-Destek Kök : Bataklık ortamlarda yaşayan bitkilerde gevşek zemine tutunmak için yanal uzanan ekstra
köklerdir.
4-Diken Kök : Koruma yeteneğini artıran özelliktir.
5- Özümleme Kökleri : Kloroplast taşıyan bu hava kökleri fotosentezde yaparlar. ÖRN : Orkideler
6- Havalandırma Kökleri : Yeterli oksijen içermeyen bataklık ve sulak ortam bitkilerinde negatif jeotropizm
gösteren kökler toprak ve su üstüne çıkarak O2 alınımında rol oynarlar. ÖRN: Mangrove , Metroxylan
hurmalarında.
7-Sömürme Kökleri : Parazit bitkilerde kökler diğer(Konukçu) bitkinin dokularına girebilecek emeçler haline
dönüşmüştür. ÖRN: Ökse otu
8-Gövde teşkil eden kökler: Kökler yan tomurcuklar vererek yeni bitkiler oluştururlar. ÖRN: Yabanıl otlar.
Önemli notlar:
1-Depo kök ve gövde oluşturan kökler vegetatif üreme gerçekleştirirler.
2-Havalandırma kökleri negatif jeotropizm gösterirler.
3-Yabanıl otlarla mücadelenin zorluğu gövde teşkil eden kökler bulundurmasındandır.
4-Su ortamında yaşayan ve bütün yüzeyi ile su alabilen bitkilerde kök bulunmaz.
B-Gövde:
lkse gövde oluşumu karayosunlarında görülür letim demetlerine sahip gövde eğreltilerde görülür. Ancak
gerçek gövde oluşumu çiçekli bitkilerde görülür.
Gövdeyi kökten ayıran özellikler:
1-Yaprak taşırlar.
2-Hem uçtan hemde intekalar büyür.
3-Lentisel , stoma , hidatot gibi madde alış verişinde görev alan yapılar taşırlar.
4-Negatif jeotropizma gösterirler.
Gövde metamorfozları:
1-Depo gövdeler: Genellikle toprak altında bulunurlar. Toprak üstüne yapraklar toprak altına ise kökler
oluştururlar. Organik madde depo ederler. ÖRN: Patates
2-Sülük gövde: Gövdeden ayrılan yan dallar sülük gibi tutunma işlevini görmek için farklılaşmıştır. bitkinin
diğer cisimlere tutunup destek almasını sağlarlar. ÖRN:Asma
3-Yapraksı özümleme kökleri: Kurak ortam bitkilerinde dumura uğrayan yaprakların görevini gövde üstlenir
ve özümleme yaparlar. ÖRN:Kuşkonmaz , Zambak
4-Diken gövde: Gövdeden çıkan yan dallar diken şeklini alarak koruma işini üstlenir .ÖRN: Ahududu
C-Yaprak:
Yaprak metamorfozları:
1-Besleyici yapraklar: Kısa , kalın , renksizdir. Besin depolarlar.
ÖRN:Soğan
2-Diken yapraklar: Çöl ortamında terlemenin azaltılması ve korunma gibi yaşamsal adaptasyonları olan
bitkilerde görülür .
ÖRN: Devedikeni
3-Sülük yapraklar: Zayıf gövdeli bazı bitkilerde başka cisimlerden destek almak amacı ile yapraklar sülük
halini almıştır.
ÖRN: Bezelye
4-Su depo yaprakları: Kurak ortamlarda yaşayan bazı bitkilerde yapraklar su depolamak için özelleşmiştir.
ÖRN: Makas otu
5-Kapan (Tuzak) yapraklar: nsektivor bitkilerde yapraklar böcek kapanı haline dönüşmüştür. Bu sayede
bitkiler azot ihtiyacını yakaladıkları böcekleri sindirerek karşılarlar.
ÖRN: Drosera, Nephentes, Dionea
Hidatotlar:
1-Su ve bataklık bitkilerinin yapraklarında bulunur.
2-ki kilit hücresi bulunur ancak açıklık hücreler tarafından kontrol edilemez.
3-Odun boruları ile bağlantılıdırlar.
4-Fazla suyun sıvı halde dışa atılımını sağlarlar.
5-Bitkilerde boşaltıma yardımcı yapılardır.
Kutiküla:
1) Epidermisin salgısı olarak meydana gelir.
2) Kalınlığı bitkinin su kayıbına toleransına bağlı olarak değişir.(Sulak ortam bitkilerinde incedir.)
3) Canlı ve nazik olan alt dokulardaki hücreleri fiziksel , kimyasal , biyolojik olumsuzluklara karşı korur.
4) Su kayıbını önleyici görev üstlenir.(Azda olsa transpirasyonla su kaybı vardır .)
5) Stoma hücrelerinde bulunmaz.

Dicle Üniversitesi Biyoloji Bölümü Dersleri

BİYOLOJİ BÖLÜMÜ 2008–2009 ÖĞRETİM YILI I. YARIYIL DERS PROGRAMI (NORMAL ÖĞRETİM)
8 - 9
9 - 10
10.- 11
11 – 12
13-14
14-15
15-16
16-17
17-
18
D
Pazartesi
I
İNG101
D
27
İNG101
D
27
BİY101
GENEL
BİYOLOJİ.
D
7
BİY101
GENEL
BİYOLOJİ.
D
7
KİM105
GENEL. KİMYA
D
4
KİM105
GENEL. KİMYA
D
4
II
BİY223
OMURGASIZ.
D
10
BİY223
OMURGASIZ.
D
10
BİY223
OMURGASIZ
D
10
BİY261
OMURGASIZ
LAB.
L3
BİY261
OMURGASIZ
LAB.
L3
III
BİY357
SPORLU LAB
L1
BİY357
SPORLU LAB
L1
BİY315
SPORLU
L1
BİY315
SPORLU
L1
BİY311
BİYOKİMYA
D
9
BİY311
BİYOKİMYA
D
9
IV
Sal
ı
I
TAR101
D 27
TAR101
D 27
FİZ121
GENEL FİZİK
D
10
FİZ121
GENEL FİZİK
D
10
II
BİY225
MİKROTEKNİK
D
9
BİY225
MİKROTEKNİK
D
9
BİY225
MİKROTEKNİK
D
9
BİY221
FİZYOLOJİ
D 9
BİY221
FİZYOLOJİ
D 9
BİY221
FİZYOLOJİ
D
9
III
BİY353
GENETİK LAB.
L3
BİY353
GENETİK LAB.
L3
IV
BİY439
BİYOFİZİK
D
10
BİY439
BİYOFİZİK
D
10
BİY415
DAVRANIŞ
D 10
BİY415
DAVRANIŞ
D 10
Çar
ş
amba
I
BİY101
GENELBİYOLOJİ
D
7
BİY101
GENELBİOLOJİ
D
7
KİM105
GENEL. KİMYA
D
3
KİM105
GENEL. KİMYA
D
3
II
BİY201
SİTOLOJİ
D
10
BİY201
SİTOLOJİ
D
10
BİY267
MİKROBİYOLOJİ
LAB
L3
BİY267
MİKROBİYOLOJİ
LAB
L3
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D
9
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D
9
III
BİY319
BİTKİ EMBR
L3
BİY319
BİTKİ EMBR
L3
BİY313
GENETİK
D
10
BİY313
GENETİK
D
10
BİY361
BİTKİ EMB LAB
L1
BİY361
BİTKİ EMB LAB
L1
IV
Per
ş
embe
I
II
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D
9
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D
9
BİY259
FİZYOLOJİ LAB
L3
BİY259
FİZYOLOJİ LAB
L3
BİY251
SİTOLOJİ LAB
L3
BİY251
SİTOLOJİ LAB
L3
III
IV
BİY419
HİDROBİYOLOJİ
D
10
BİY419
HİDROBİYOLOJİ
D
10
BİY401
BİYOMETRİ
D
10
BİY401
BİYOMETRİ
D
10
Cuma
I
BİY151
GENEL BİO. LAB.
L1
BİY151
GENEL BİO. LAB.
L1
BİY151
GENEL BİO. LAB
L1
BİY151
GENEL BİO.
LAB.
L1
TUR101
A2
TUR101
A2
II
III
BİY311
BİYOKİMYA
D
9
BİY311
BİYOKİMYA
D
9
BİY313
GENETİK
L1
BİY313
GENETİK
L1
IV
BİY419
HİDROBİYOLOJİ
L
3
BİY419
HİDROBİYOLOJİ
L3
BİY417
TOKSİKOLOJİ
D10
BİY417
TOKSİKOLOJİ
D10
BİY431
ZOOCOĞRAFYA
D9
BİY431
ZOOCOĞRAFYA
D9
Prof. Dr. Yüksel COŞKUN
Biyoloji Bölüm Başkanı
Page 2
BİYOLOJİ BÖLÜMÜ 2008–2009 ÖĞRETİM YILI I. YARIYIL DERS PROGRAMI (İKİNCİ ÖĞRETİM)
8 - 9
9 - 10
10.- 11
11 – 12
13-14
14-15
15-16
16-17
17-18
D
18-19
D
Pazartesi
I
BİY101
GENEL BİOLOJİ.
D
9
BİY101
GENEL BİOLOJİ.
D
9
KİM105
GENEL KİMYA
D
10
KİM105
GENEL. KİMYA
D
10
İNG101
D
27
İNG101
27
II
BİY223
OMURGASIZ
D
10
BİY223
OMURGASIZ.
D
10
BİY223
OMURGASIZ
D
10
BİY261
OMURGASIZ LAB.
L3
BİY261
OMURGASIZ LAB.
L
3
III
BİY357
SPORLU LAB
L1
BİY357
SPORLU LAB
L1
BİY315
SPORLU
L1
BİY315
SPORLU
L
1
BİY311
BİYOKİMYA
D9
BİY311
BİYOKİMYA
D9
IV
Sal
ı
I
II
BİY225
MİKROTEKNİK
D
9
BİY225
MİKROTEKNİK
D 9
BİY225
MİKROTEKNİK
D
9
BİY221
FİZYOLOJİ
D 9
BİY221
FİZYOLOJİ
D
9
BİY221
FİZYOLOJİ
D 9
III
BİY353
GENETİK LAB.
L3
BİY353
GENETİK LAB.
L3
IV
D
10
BİY419
HİDROBİYOLOJİ
L
1
BİY419
HİDROBİYOLOJİ
L
1
BİY419
HİDROBİYO
D
9
BİY419
HİDROBİY
D
9
Çar
ş
amba
I
BİY101
GENEL BİOLOJİ
D 9
BİY101
GENEL BİOLOJİ
D 9
FİZ121
GENEL FİZİK
D 10
FİZ121
GENEL FİZİK
D
10
TAR101
A2
TAR101 A2
II
BİY201
SİTOLOJİ
D
10
BİY201
SİTOLOJİ
D 10
BİY267
MİKRO. LAB
L
3
BİY267
MİKRO. LAB
L
3
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D
9
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D
9
III
BİY319 BİTKİ
EMBR.LOJİ
L
3
BİY319 BİTKİ
EMBR.LOJİ
L
3
BİY313
GENETİK
D
10
BİY313
GENETİK
D
10
BİY361
BİTKİ EMB LAB
L1
BİY361
BİTKİ EMB LAB
L1
IV
Per
ş
embe
I
BİY151
GENEL İY.LAB..
L1
BİY151
GENEL BİY.LAB.
L1
BİY151
GENEL BİY.LAB.
L1
BİY151
GENEL BİY.LAB.
L1
TUR101
A2
TUR101 A2
II
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D
9
BİY219
MİKROBİYOLOJİ
D9
BİY259
FİZYOLOJİ LAB
L3
BİY259
FİZYOLOJİ LAB
L3
BİY251
SİTOLOJİ LAB
L3
BİY251
SİTOLOJİ LAB
L3
III
IV
BİY 417
TOKSİKOLOJİ
D9
BİY 417
TOKSİKOLOJİ
D
9
BİY439
BİYOFİZİK
D
9
BİY439
BİYOFİZİK
D9
BİY 415
DAVRANIŞ
D
9
BİY 415
DAVRANI
Ş
D
9
Cuma
I
KİM105
GENEL.
KİMYA
D
9
KİM105
GENEL.
KİMYA
D
9
II
III
BİY311
BİYOKİMYA
D9
BİY311
BİYOKİMYA
D9
BİY313
GENETİK
L1
BİY313
GENETİK
L1
IV
BİY431
ZOOCOĞRAFYA
D
9
BİY431
ZOOCOĞRAFYA
D
9
BİY401
BİYOMETRİ
D
10
BİY401
BİYOMETRİ
D
10
Page 3
Prof. Dr. Yüksel COŞKUN
Biyoloji Bölüm Başkanı
2008–09 GÜZ YARILI DERS PROGRAMI (2005-2006 Öğretim Yılı Öncesinde Okutulan Dersler (NORMAL VE İKİNCİ ÖĞRETİM)
8 - 9
9 - 10
10.- 11
11 – 12
13-14
14-15
15-16
16-17
17-18
D
18-19
D
Pazartesi
I
II
BIY 215
BIY421
D
10
BIY 215
BIY421
D
10
BIY 215
BIY421
D
10
BIY 215
BIY421
L3
BIY 265
L3
BIY 367
L2
BIY 367
L2
D
7
III
BIY 317
L2
BIY 317
L2
BIY 427
BIY 219
L1
BIY 427
BIY 219
L1
BIY 301
BIY 435
BIY447
D
9
BIY 301
BIY 435
BIY447
D
9
IV
BIY 427
L1
BIY 427
L1
Sal
ı
I
BIY 115
Biyoloji Tarihi
II
BIY 305
BIY429
BIY 449
D
9
BIY 305
BIY429
BIY 449
D
9
BIY 305
BIY429
BIY 449
D
9
III
IV
BİY425
D
10
BİY425
D
10
Çar
ş
amba
I
II
KIM 205
Organik Kimya
D
9
KIM 205
Organik Kimya
D
9
III
BİY303
D
10
BİY303
D
10
IV
Per
ş
embe
I
II
BİY217
MİKROBİYOLOJİ
D
9
BİY217
MİKROBİYOLOJİ
D
9
BİY263
L3
BİY263
L3
III
IV
BİY423
D
10
BİY423
D
10
BIY 113
Biomatematik I
D
10
BIY 113
Biomatematik I
D
10
BIY 113
Biomatematik I
L1
Cuma
I
II
III
BİY351
BİY435
D
9
BİY351
BİY311
BİYOKİMYA
D
9
BİY313
GENETİK
L1
BİY313
GENETİK
L1
IV
BİY423
L3
BİY423
L3
BİY437
D9
BİY437
D9
Prof. Dr. Yüksel COŞKUN
Biyoloji Bölüm Başkanı
Page 4
2005-2006 Öğretim Yılı Öncesinde Okutulan (Eski) Dersler (Normal ve İkinci Öğretim)
Optik
Kodu
Kodu
Dersin Adı
1009
BİY 115
Biyoloji Tarihi
1008
BİY 113
Biyomatematik
2017
BİY 219
Bitki Morfolojisi ve Sistematiği
2021
BİY 263
Bitki Morfolojisi ve Sistematiği Lab.
2015
BİY 215
Hayvan Morfolojisi ve Sistematiği
2022
BİY 265
Hayvan Morfolojisi ve Sistematiği Lab.
2016
BİY 217
Mikrobiyoloji
2032
KİM 205 Organik Kimya
3004
BİY 301
Biyokimya I
3011
BİY 351
Biyokimya I Lab.
3005
BİY 303
Genetik
3006
BİY 305
Bitki Fizyolojisi
3013
BİY 355
Bitki Fizyolojisi Lab.
3010
BİY 317
Hayvan Embriyolojisi ve Morfolojisi
3016
BİY 367
Hayvan Embriyolojisi ve Morfolojisi Lab.
3009
BİY 309
Evrim
4011
BİY 421
Omurgasız Hayvanlar Sistematiği
4037
BİY 423
Tatlısu Ekolojisi
4013
BİY 425
Davranış Biyolojisi
4014
BİY 427
Sporlu Bitkiler Sistematiği
4015
BİY 429
Bitki Besleme ve Metabolizması
4017
BİY 433
Bitki Biyoteknolojisi
4018
BİY 435
Enzimoloji
4019
BİY 437
Toksikoloji
4022
BİY 443
Karşılaştırmalı Hayvan Fizyolojisi
4024
BİY 447
Genler ve Fonksiyonları
4025
BİY 449
Bitkisel Hormonlar
Prof. Dr. Yüksel COŞKUN
Page 5
Biyoloji Bölüm Başkanı

YÖK dersleri

1.001 Aerodinamik
2.102 Sağlık Kurumları Yönetimi
1.002 Akışkanlar Mekaniği
2.103 Sağlık Psikolojisi
1.003 Akustik ve Titreşimler
2.104 Sağlık ve Beden Sosyolojisi
1.004 Analitik Kimya
2.105 Sanat Felsefesi
1.005 Anorganik Kimya
2.106 Sanayi İktisadı
1.006 Astronomi, Astrofizik ve Uzay
Bilimleri
2.107 Sinema
1.007 Atmosfer Bilimleri
2.108 Sınıf ve Tabakalaşma Sosyolojisi
1.008 Atom, Molekül ve Plazma Fiziği
2.109 Sivil Havacılık Yönetimi
1.009 Ayırma İşlemleri
2.110 Siyasal Akımlar ve Siyasal Düşünce Tarihi
1.010 Bakteriyoloji
2.111 Siyasal Coğrafya
1.011 Bilgi ve Kodlama Teorisi, Kriptoloji
2.112 Siyaset Bilimi Metodolojisi
1.012 Bilgisayar Destekli Tasarım
2.113 Siyaset Felsefesi
1.013 Bilgisayar Sistem Yapısı ve Donanımı
2.114 Siyaset Psikolojisi
1.014 Bilgisayar Yazılımı
2.115 Siyaset Sosyolojisi
1.015 Bitki Fizyolojisi
2.116 Siyasi Düşünce Tarihi
1.016 Bitki Morfolojisi ve Anatomisi
2.117 Siyasi İletişim
1.017 Bitki Sistematiği
2.118 Sosyal Demografi
1.018 Biyofizik
2.119 Sosyal Güvenlik
1.019 Biyoinformatik
2.120 Sosyal Hareketler ve Kimlikler Sosyolojisi
1.020 Biyokimya
2.121 Sosyal Hizmet
1.021 Biyomedikal
2.122 Sosyoloji Kuramları, Tarihi ve Metodolojisi
1.022 Biyomekanik
2.123 Spor Psikolojisi
1.023 Biyoteknoloji
2.124 Su Altı Arkeolojisi
1.024 Bölge Planlama
2.125 Suç ve Sapma Sosyolojisi
1.025 Cebir ve Sayılar Teorisi
2.126 Tarım İktisadı
1.026 Coğrafi Bilgi Sistemleri
2.127 Tasavvuf
1.027 Çevre Sistemleri ve Modelleme
2.128 Tefsir
1.028 Deniz Jeolojisi ve Jeofiziği
2.129 Teknik Demografi
1.029 Deprem Mühendisliği
2.130 Teknoloji ve Yenilik İktisadı
1.030 Deri Teknolojisi
2.131 Teknoloji ve Yenilik Yönetimi
1.031 Devreler ve Sistem Teorisi
2.132 Ticaret Hukuku
1.032 Ekoloji
2.133 Toplum ve Tarih Felsefesi
1.033 Elektrik Makineleri ve Enerji Üretimi
2.134 Toplumsal Cinsiyet ve Kadın Araştırmaları
1.034 Elektromanyetik ve Mikrodalga
2.135 Toprak Coğrafyası
1.035 Elektronik
2.136 Trafik Psikolojisi
1.036 Endüstri Ürünleri Tasarımı
2.137 Turizm ve Otelcilik İşletmeciliği
1.037 Endüstriyel Mikrobiyoloji
2.138 Türk Dış Politikası
1.038 Enerji Teknolojileri
2.139 Türk Siyasal Hayatı
1.039 Ergonomi
2.140 Uluslararası İletişim
1.040 Fiziksel Çevre Denetimi
2.141 Uluslararası İşletmecilik
1.041 Fiziksel Kimya
2.142 Uluslararası Kamu Hukuku
1.042 Fotogrametri
2.143 Uluslararası Kurumlar
1.043 Gelişim Biyolojisi
2.144 Uluslararası Özel Hukuk
1.044 Gemi İnşaatı
2.145 Uluslararası Siyaset
1.045 Gemi Yönetimi
2.146 Uluslararası Ticaret
1.046 Gen Mühendisliği
2.147 Yeniçağ Felsefesi
1.047 Genel Jeoloji
2.148 Yerleşim Arkeolojisi
1.048 Genetik
2.149 Yerleşme Coğrafyası
1.049 Geometri
2.150 Yirminci Yüzyıl Felsefesi
1.050 Geoteknik Mühendisliği
2.151 Yönetim Psikolojisi
1.051 Gıda Bilimi
2.152 Yönetim Sosyolojisi


1.052 Gıda Teknolojileri
2.153 Bilişsel Psikoloji
1.053 Haberleşme
2.154 Biyo Psikoloji
1.054 Hava Kirliliği ve Kontrolü
2.155 Öğrenme Psikolojisi
1.055 Hava-Uzay Araçları Tasarımı ve
Malzemesi
3.001 Ağaç Malzeme Eğitimi
1.056 Hava-Uzay Ulaşım
3.002 Aile Kaynakları Eğitimi
1.057 Hayvan Fizyolojisi-Ekofizyolojisi
3.003 Aydınlatma ve Tesisat Eğitimi
1.058 Hayvan Sistematiği
3.004 Baskı ve Dizgi Eğitimi
1.059 Hesaplama Bilimleri
3.005 Beslenme Eğitimi
1.060 Hidrobiyoloji
3.006 Bilgisayar Sistemleri Eğitimi
1.061 Hidrojeoloji
3.007 Büro Yönetimi Eğitimi
1.062 İç Mimari Tasarım
3.008 Çocuk Gelişimi Eğitimi
1.063 İletişim Şebekeleri ve Bilgisayar
Ağları
3.009 Dekoratif Ürünler Eğitimi
1.064 İmmünoloji
3.010 Dokuma-Örgü ve Nakış Eğitimi
1.065 Isı Transferi
3.011 Döküm ve Model Eğitimi
1.066 İstatistiksel Analiz
3.012 Elektrik Makineleri Eğitimi
1.067 İşaret İşleme
3.013 Elektronik Eğitimi
1.068 İtki Sistemleri
3.014 Endüstriyel Teknoloji Eğitimi
1.069 Jeodezi ve Ölçme Teknikleri
3.015 Enerji Eğitimi
1.070 Kalite Yönetimi
3.016 Enerji Tesisleri Eğitimi
1.071 Karar Destek Sistemleri
3.017 Giyim Endüstrisi Eğitimi
1.072 Kartografya
3.018 Grafik Eğitimi
1.073 Katı Cisimler Mekaniği
3.019 Kaynak Eğitimi
1.074 Katı ve Tehlikeli Atıklar
3.020 Kontrol Eğitimi
1.075 Katıhal ve Malzeme Kimyası
3.021 Masa Üstü Yayıncılık Eğitimi
1.076 Kaya Mekaniği
3.022 Mekanik Metalurji ve Malzeme Eğitimi
1.077 Kentsel Planlama
3.023 Mobilya ve Dekorasyon Eğitimi
1.078 Kentsel Tasarım
3.024 Moda Tasarımı Eğitimi
1.079 Kimyasal Proses Tasarımı
3.025 Muhasebe ve Finansman Eğitimi
1.080 Kimyasal Reaksiyon Mühendisliği
3.026 Otomotiv Eğitimi
1.081 Kimyasal-Biyolojik Kazanma
Teknikleri ve Cevher Hazırlama
3.027 Seramik Eğitimi
1.082 Kırılma Mekaniği
3.028 Talaşlı Üretim ve Kalıpçılık Eğitimi
1.083 Kıyı Bilimleri ve Mühendisliği
3.029 Tasarım ve Konstrüksiyon Eğitimi
1.084 Kontrol Teorisi ve Uygulamaları
3.030 Tekstil Teknolojisi Eğitimi
1.085 Koruma, Yenileme ve Restorasyon
3.031 Tekstil Terbiye Tekniği Eğitimi
1.086 Kütle Transferi
3.032 Telekomünikasyon Eğitimi
1.087 Maden Mühendisliği Proses Tasarımı,
İşletmesi ve Ekonomisi
3.033 Turizm İşletmeciliği Eğitimi
1.088 Maden Yatakları ve Jeokimya
3.034 Üretim Yönetimi ve Pazarlama Eğitimi
1.089 Madencilik Yöntemleri ve Maden
Sistem Analizi
3.035 Yapı Bilgisi Eğitimi
1.090 Makine Tasarımı ve Makine
Elemanları
3.036 Yapı Tasarımı Eğitimi
1.091 Makine Teorisi ve Dinamiği
3.037 Yönetim ve Organizasyon Eğitimi
1.092 Malzeme Bilimi
4.001 Alman Dili ve Edebiyatı
1.093 Malzeme Tasarım ve Davranışları
4.002 Amerikan Edebiyatı
1.094 Malzeme Üretim Teknolojileri
4.003 Arap Dili ve Edebiyatı
1.095 Matematiksel Analiz
4.004 Bulgar Dili ve Edebiyatı
1.096 Mekatronik
4.005 Çağdaş Yunan Dili ve Edebiyatı
1.097 Meteoroloji
4.006 Çin Dili ve Edebiyatı
1.098 Mikoloji
4.007 "Çuvaş; Güney-Batı ""Oğuz"" Lehçesi ve
Edebiyatı"


1.099 Mimari Tasarım
4.008 Ermeni Dili
1.100 Mimari Tasarım Kuramları
4.009 Eski Anadolu Türkçesi
1.101 Mimarlık Tarihi
4.011 Eski Türk Edebiyatı
1.102 Mimarlıkta Malzeme
4.012 Fars Dili ve Edebiyatı
1.103 Mineraloji-Petrografi
4.013 Fransız Dili ve Edebiyatı
1.104 Moleküler Genetik
4.014 Güney-Doğu (Türkistan/Uygur) Lehçesi ve
Edebiyatı
1.105 Moleküler Hücre Biyolojisi
4.015 Halk Edebiyatı
1.106 Mühendislik Ekonomisi
4.016 Hindoloji
1.107 Nükleer Bilimler
4.017 Hititoloji
1.108 Nükleer Fizik
4.018 Hollanda Dili ve Edebiyatı
1.109 Nükleer Teknoloji
4.019 İngiliz Dili ve Edebiyatı
1.110 Olasılık ve Stokastik Süreçler
4.020 İspanyol Dili ve Edebiyatı
1.111 Optik, Fotonik
4.021 İtalyan Dili ve Edebiyatı
1.112 Organik Kimya
4.022 Japon Dili ve Edebiyatı
1.113 Oşinografi
4.023 Karşılaştırmalı Edebiyat
1.114 Parazitoloji
4.024 Kore Dili ve Edebiyatı
1.115 Petrol ve Gaz Üretimi
4.025 Köktürkçe
1.116 Peyzaj Tasarımı
4.026 "Kuzey-Batı ""Kıpçak"" Lehçesi ve
Edebiyatı"
1.117 Polimer Bilimi
4.027 "Kuzey-Doğu ""Saha (Yakut), Tuva, Hakas,
Altay"" Lehçesi ve Edebiyatı"
1.118 Polimer Teknolojisi
4.028 Latin Dili ve Edebiyatı
1.119 Proje ve Yapım Yönetimi
4.029 Latin-Yunan Epigrafisi
1.120 Rezervuar Mühendisliği
4.030 Leh Dili ve Edebiyatı
1.121 Risk Analizi
4.031 Macar Dili ve Edebiyatı
1.122 Seramik/İnorganik Malzemeler
4.032 Orta Türkçe (Karahanlı, Harezm, Çağatay,
Kıpçak Türkçesi)
1.123 Sismoloji
4.033 Osmanlı Türkçesi
1.124 Sondaj
4.034 Rus Dili ve Edebiyatı
1.125 Su Kaynakları ve Su Yapıları
4.035 Sümeroloji
1.126 Su Kirliliği ve Kontrolü
4.036 Türkiye Türkçesi
1.127 Sürekli Ortam Mekaniği
4.037 Urdu Dili
1.128 Tekstil Bilimi
4.038 Uygurca
1.129 Tekstil Teknolojisi
4.039 Yeni Türk Edebiyatı
1.130 Teorik Kimya
4.040 Yunan Dili ve Edebiyatı
1.131 Termodinamik
5.001 Ağaç Malzeme Teknolojisi
1.132 Topoloji
5.002 Akaroloji
1.133 Toprak Kirliliği ve Kontrolü
5.003 Avlama Teknolojileri
1.134 Ulaşım Mühendisliği
5.004 Bağ Yetiştirme ve Islahı
1.135 Uydu Teknolojileri
5.005 Bakteriyel Bitki Hastalıkları
1.136 Uygulamalı Jeofizik
5.006 Besin Hijyeni ve Teknolojisi
1.137 Uygulamalı Jeoloji
5.007 Bitki Besleme ve Toprak Verimliliği
1.138 Uygulamalı Matematik
5.008 Büyükbaş Hayvan Yetiştirme ve Islahı
1.139 Uzaktan Algılama
5.009 Çayır-Mera ve Yem Bitkileri
1.140 Üretim Teknolojileri
5.010 Drenaj
1.141 Üretim ve Servis Sistemleri
5.011 Endüstri Bitkileri Yetiştirme ve Islahı
1.142 Viroloji
5.012 Fungal Bitki Hastalıkları
1.143 Yapı Malzemeleri
5.013 Hasat Sonrası İşlemleri
1.144 Yapı Mühendisliği
5.014 Hayvan Besleme
1.145 Yapısal Bütünlük ve Hasar
5.015 Hayvan Beslenme Hastalıkları
1.146 Yer Fiziği
5.016 Herboloji
1.147 Yoğun Madde Fiziği ve İstatistik Fizik
5.017 İşleme Teknolojileri
1.148 Yöneylem Araştırması
5.018 Kanatlı Hayvan Yetiştirme ve Islahı


1.149 Yüksek Enerji ve Parçacık Fiziği
5.019 Küçükbaş Hayvan Yetiştirme ve Islahı
1.150 Yüksek Gerilim, İletim ve Dağıtım
Sistemleri
5.020 Meyve Yetiştirme ve Islahı
1.151 Yapı ve Yapım Teknolojisi
5.021 Nematoloji
2.001 Adalet ve Suç Psikolojisi
5.022 Orman Amenajmanı ve Hasılatı
2.002 Aile Sosyolojisi
5.023 Orman Ekonomisi ve İşletmeciliği
2.003 Anayasa Hukuku
5.024 Orman Koruma
2.004 Anayasa ve Siyasal Kurumlar
5.025 Orman Ürünleri Teknolojisi
2.005 Arkeometri
5.026 Orman Ürünleri Transportu
2.006 Arşiv
5.027 Peyzaj Planlama
2.007 Askeri Coğrafya
5.028 Sebze Yetiştirme ve Islahı
2.008 Avrupa Birliği Hukuku
5.029 Silvikültür
2.009 Avrupa Birliği-Türkiye İlişkileri
5.030 Su Ürünleri Yetiştiriciliği
2.010 Bilim ve Teknoloji Tarihi
5.031 Sulama
2.011 Biyocoğrafya
5.032 Süs Bitkileri Yetiştirme ve Islahı
2.012 Bölgesel İktisat
5.033 Tahıl Yetiştirme ve Islahı
2.013 Bütçe ve Mali Planlama
5.034 Tarım Makineleri
2.014 Büyüme İktisadı
5.035 Tarım Politikası
2.015 Ceza ve Ceza Usulü Hukuku
5.036 Tarımda Enerji Kullanımı
2.016 Çalışma Ekonomisi ve Endüstri
İlişkileri
5.037 Tarımsal Biyoteknoloji
2.017 Çalışma İktisadı ve İktisadi
Demografi
5.038 Tarımsal Pazarlama
2.018 Çalışma Psikolojisi
5.039 Tarımsal Yapılar
2.019 Çalışma Sosyolojisi
5.040 Tarımsal Yayım ve Haberleşme
2.020 Çevre Hukuku
5.041 Toprak Bilimi
2.021 Çevre Politikası
5.042 Toprak Ekolojisi
2.022 Değer Felsefesi
5.043 Toprak-Su Koruma
2.023 Değişme, Azgelişmişlik ve
Modernleşme Sosyolojisi
5.044 Veteriner Anatomi
2.024 Deniz Hukuku
5.045 Veteriner Biyokimya
2.025 Deniz İşletmeciliği
5.046 Veteriner Cerrahi
2.026 Dil Felsefesi
5.047 Veteriner Doğum, Jinekoloji ve Suni
Tohumlama
2.027 Dil Psikolojisi
5.048 Veteriner Farmakoloji ve Toksikoloji
2.028 Din Felsefesi
5.049 Veteriner Fizyoloji
2.029 Din Psikolojisi
5.050 Veteriner Hekimlik Tarihi ve Etik
2.030 Din, Bilgi ve Kültür Sosyolojisi
5.051 Veteriner Histoloji ve Embriyoloji
2.031 Dinler Tarihi
5.052 Veteriner İç Hastalıkları
2.032 Doğal Kaynaklar ve Çevre İktisadı
5.053 Veteriner Mikrobiyoloji
2.033 Dokümantasyon
5.054 Veteriner Parazitoloji
2.034 Eğitim İktisadı
5.055 Veteriner Patoloji
2.035 Ekonomik Coğrafya
5.056 Viral Bitki Hastalıkları
2.036 Ekonomik Demografi
5.057 Yem Teknolojisi
2.037 Epistemoloji ve Bilim Felsefesi
6.001 Almanca Eğitimi
2.038 Eskiçağ Felsefesi
6.002 Arapça Eğitimi
2.039 Etik
6.003 Beden Eğitimi ve Spor
2.040 Etnoloji
6.004 Bilgisayar ve Öğretim Teknolojileri Eğitimi
2.041 Ev Ekonomisi
6.005 Biyoloji Eğitimi
2.042 Finans
6.006 Coğrafya Eğitimi
2.043 Finansal İktisat
6.007 Çok Engellilerin Eğitimi
2.044 Fotoğraf
6.008 Din Eğitimi
2.045 Gazetecilik
6.009 Eğitim Felsefesi
2.046 Gelişme İktisadı
6.010 Eğitim Programları ve Öğretim


2.047 Genel Kamu Hukuku
6.011 Eğitim Psikolojisi
2.048 Hadis
6.012 Eğitim Sosyolojisi
2.049 Halk Bilim
6.013 Eğitim Tarihi
2.050 Halkla İlişkiler
6.014 Eğitim Yönetimi, Teftişi, Planlaması ve
Ekonomisi
2.051 Hidrografya
6.015 Eğitimde Ölçme ve Değerlendirme
2.052 Hukuk Felsefesi ve Sosyolojisi
6.016 Felsefe Grubu Eğitimi
2.053 Hukuk Tarihi
6.017 Fen Bilgisi Eğitimi
2.054 İdare Hukuku
6.018 Fizik Eğitimi
2.055 İktisadi Modeller ve Programlama
6.019 Fransızca Eğitimi
2.056 İktisat Metodolojisi
6.020 Görme Engellilerin Eğitimi
2.057 İletişim Ekonomisi
6.021 İngilizce Eğitimi
2.058 İletişim Etiği
6.022 İşitme Engellilerin Eğitimi
2.059 İletişim Psikolojisi
6.023 Japonca Eğitimi
2.060 İletişim Sosyolojisi
6.024 Kimya Eğitimi
2.061 İnsan Felsefesi
6.025 Konuşma Engellilerin Eğitimi
2.062 İnsan Kaynakları Yönetimi
6.026 Matematik Eğitimi
2.063 İslam Felsefesi
6.027 Müzik Eğitimi
2.064 İslam Hukuku
6.028 Okul Öncesi Eğitimi
2.065 İslam Mezhepleri Tarihi
6.029 Özel Eğitim
2.066 İslam Tarihi
6.030 Rehberlik ve Psikolojik Danışmanlık
2.067 İş ve Örgütler Sosyolojisi
6.031 Resim/Resim İş Eğitimi
2.068 İş ve Sosyal Güvenlik Hukuku
6.032 Sosyal Bilgiler Eğitimi
2.069 İşçi Sağlığı ve İş Güvenliği
6.033 Tarih Eğitimi
2.070 Jeoarkeoloji
6.034 Türk Dili ve Edebiyatı Eğitimi
2.071 Jeomorfoloji
6.035 Türkçe Eğitimi
2.072 Karşılaştırmalı Hukuk
6.036 Üstün Zekalıların Eğitimi
2.073 Kelam
6.037 Yetişkinler Eğitimi/Halk Eğitimi
2.074 Kişilerarası İletişim
6.038 Zihinsel Engellilerin Eğitimi
2.075 Kişilik Psikolojisi
7.001 Cilt Tasarımı
2.076 Kitle İletişimi
7.002 Çini Tasarımı
2.077 Klimatoloji
7.003 Çizgi Film-Animasyon
2.078 Kooperatifçilik
7.004 Dans ve Koreografi
2.079 Köy, Kent, Göç ve Gecekondu
Sosyolojisi
7.005 Fotoğraf
2.080 Kültürlerarası İletişim
7.006 Grafik Tasarımı
2.081 Kütüphanecilik
7.007 Halı, Kilim ve Dokuma Tasarımı
2.082 Mali Hukuk
7.008 Hat Tasarımı
2.083 Mali İktisat
7.009 Heykel
2.084 Maliye Kuramı
7.010 Kompozisyon
2.085 Mantık
7.011 Müzik Teknolojileri
2.086 Medeni Hukuk
7.012 Müzik Teorileri
2.087 Medeni Usul ve İcra İflas Hukuku
7.013 Müzikoloji
2.088 Muhasebe
7.014 Opera Şarkıcılığı ve Rejisörlüğü
2.089 Nüfus Coğrafyası
7.015 Oyunculuk-Reji
2.090 Ontoloji
7.016 Resim
2.091 Ortaçağ Felsefesi
7.017 Sahne Tasarımı
2.092 Örgüt ve Grup İletişimi
7.018 Seramik-Cam
2.093 Örgütsel Davranış
7.019 Sinema-TV Yapım ve Yönetimi
2.094 Polis ve İç Güvenlik Araştırmaları
7.020 Tekstil ve Moda Tasarımı
2.095 Primatoloji
7.021 Tezhip Tasarımı
2.096 Psikolojide Ölçme Teknikleri
7.022 Tiyatro Kuramı
2.097 Radyo-Televizyon
7.023 Türk Halk Müziği
2.098 Refah İktisadı
7.024 Türk Sanat Müziği


2.099 Reklam
7.025 Yorumculuk
2.100 Roma Hukuku
7.026 Yorum-Dramatik Yazarlık
2.101 Sağlık İktisadı

24 Şubat 2009 Salı

Ders İçerikleri

BİTKİ FİZYOLOJİSİ
BIO 301
3 ECTS Kredisi 1.yıl 1.yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta, Laboratuar: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Yeşim KARA (eylul@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersin temel hedefi; bitki büyüme ve gelişmesinin temel kavram ve prensiplerinin
öğrenciye açık bir şekilde sunulmasıdır.
Dersin İçeriği
Bitki Fizyolojisine giriş, Bitkilerde su metabolizması, Suyun bitkilere alınımı, Mineral
maddeler ve alınımı, Stoma oluşumu, Bitkilerde sentez. Toprak ve etkileri, Büyüme ve
gelişme, bitki hormonları ve etki mekanizmaları, aktif ve pasif taşıma.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda dönem içersinde 2 arasınav ve dönem sonunda 1 final sınavı yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Bozcuk, S., “ Bitki Fizyolojisi”, Hatipoğlu Yayıncılık, 223 p., ANKARA, (1997).
• Kocaçalışkan, İ., “Bitki Fizyolojisi”, DPÜ Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü,
420 p., KÜTAHYA, (2004).
BİYOKİMYA I
BIO305
5 ECTS Kredisi
3. Sınıf - 1. Dönem
Lisans
Zorunlu
3 saat/hafta
Dersler: 3 saat/hafta
Türkçe
İrtibat: Alaattin SEN (sena@pamukkale.edu.tr)
URL: http://biyoloji.pamukkale.edu.tr/alaattin/index.htm
Dersin Amacı ve Hedefi
İki dönemlik serinin ilk dönemi, modern biyokimyanın prensiplerine eksiksiz bir giriş
sağlamaktadır. Bu dersin ana hedefi öğrencilere biyokimyanın prensiplerini ve temel
konseptlerini vermektir.
Dersin İçeriği
Ana başlıklar; su, pH ve onların hücresel aktivitelere etkileri; amino asit ve türevlerinin
kimyası; izolasyon ve tanımlama metodları; proteinlerin primer, sekonder, tersiyer ve
quarterner yapıları; protein yapılarının belirlenmesi ve biyokimyasal uygulamalar; nükleosit
Page 2
ve nükleotitlerin bilimsel adlandırılması; DNA ve RNA’nın yapısı; proteinler, karbohidratlar
ve lipitlerin özellikleri; enzimler ve onların özelliklerine girişi içerir.
Dersin Değerlendirilmesi
Değerlendirme genellikle ders esnasında devam eder (toplam %25), ders periyodunda bir
yazılı sınav (%25) ve ders sonunda bir final sınavı (%50) olarak tasarlanmıştır.
Ön Koşul/Önerilen
Genel ve Organik Kimya
Ders Kitabı/Materyali
• D. L. Nelson & M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry 4th Ed, W.H.
Freeman and Co., 2005.
• C. K. Mathews, K. E.. van Holde & K. G. Ahern: Biochemistry 3rd Ed.,
Benjamin/Cummings, 2000.
GENETİK-I
BIO 309
5 ECTS Kredisi
3. Yıl – I. Dönem
Zorunlu
3 saat/hafta
Dersler: 3 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Fevziye CELEBİ TOPRAK (fctoprak@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Genetik alanında çalışmak biyoloji ve tıp alanında heyecan verici ve çok hızlı bir gelişme
gösteren alandır. Kurs sırasında öğrenciler ökaryot ve prokaryot genetiğinin temelini
öğreneceklerdir. Ayrıca gen bağlantısı ve rekombinasyon konularıda öğrencilere verilecektir.
Bu dersi alan öğrenciler genetik problemleri ile karşılaştıklarında bunlara nasıl bir çözüm
getireceklerini kolaylıkla bulabilmeleridir.
Dersin İçeriği
Genetiğe Giriş: Tarihçe ve genetiğin tarihsel gelişimi,
Kromozom teorisinin kalıtımı: genetik maddenin tanımı, gen ve kromozom, hücre bölünmesi
(mitoz ve mayoz), kromozomların kalıtımı ve bu konular ile ilgili problem çözümleri.
Mendel Genetiğiı: Mendel kanunları, ki-kare analizi ve pedigri
Page 3
Mendel Genetiğinin Uzantıları: Dominantlıktaki çeşitlilik (Kodominant ve eksik baskınlık),
aynı karakter üzerine çeşitli gen etkileşimleri (epistasi), pleitropi, çok allelilik, lethal etkili
alleller, X’ bağlı kalıtım, eşeyle sınırlı kalıtım ve çevrenin etkisinden etkilenme gibi.
Linkage Bağlı genler:bağlı genlerin meydana çıkarılması, rekombinasyonlar, gen haritası, 3
noktalı test çaprazlama, interferans, bağlı gen haritasına örnekler, krossin-over’ın doğası,
tetrat analizi, mitotik rekombinasyonu and segregasyon.
Dersin Değerlendirirlmesi
Bir yarıyılda 2 yazılı ara sınav, quizler (%50) ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50)
yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyaller
• Griffiths, A. J. F., Miller, J. H., Suzuki, D.T., Lewontin, R. C., Gelbart, W. M. ‘’An
Introduction to Genetic Analysis’’, 6. Edition. W.H. Freeman and Company New
York, (1996)
• Hartwell, L. H., Hood, L., Goldberg, M.L., Reynolds, A.E., Silver, L.M., Veres, R.C.,
‘’Genetics From Genes to Genoms’’, Mc Graw Hill, (2000)
• Klug, W.S., Cummings, M.R., ‘’Genetik Kavramlar’’ Çeviri Editörü Prof. Dr. Cihan
Öner. Palme Yayıncılık, (2002)
• Çeşitli internet kaynakları
BİTKİ FİZYOLOJİSİ LABORATUVARI
BIO 303
2 ECTS Kredisi
1.yıl 1.yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Yeşim KARA (eylul@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersin temel hedefi; bitki büyüme ve gelişmesinin temel kavram ve prensiplerinin
öğrenciye açık bir şekilde sunulmasıdır.
Dersin İçeriği
Bitki fizyolojisine giriş, Bitkilerde su metabolizması, Bitkilerde mineral maddeler ve alınımı,
mineral alınımını etkileyen faktörler, Bitkilerde su kaybı, Bitkilerde sentez evreleri,
(Fotosentez, Kemosentez), Solunum ve bitkilerdeki evreleri (Bitkilerde organik maddelerin
taşınımı), Bitkilerde büyüme ve gelişme, hormonların etki mekanizmaları.
Page 4
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda dönem içersinde 2 ara sınav ve dönem sonunda 1 final sınavı yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Kara, Y., Zeytünlüoğlu, A., Semiz, G., “Bitki Fizyolojisi Laboratuvar Kılavuzu”, 49
sayfa, DENİZLİ, (2003).
BİYOKİMYA LABORATUARI
BIO3XX
3 ECTS Kredisi
3. Sınıf – 1. Dönem
Lisans
Zorunlu
3 saat/hafta
Laboratuar: 3 saat/hafta
Türkçe
İrtibat: Alaattin SEN (sena@pamukkale.edu.tr)
URL: http://biyoloji.pamukkale.edu.tr/alaattin/index.htm
Dersin Amacı ve Hedefi
Biyokimyasal araştırmaların modern metotları. Laboratuar deneyleri, biyolojik aktif
materyaller ile çalışmada tecrübe ve standart biyokimyasal tekniklere yakınlık sağlamak üzere
tasarlanmıştır. Spektrofotometre; kromatografi; santrifüj; enzim kinetiği; proteinlerin, nükleik
asitlerin ve subcellular organellerin izolasyonu, saflaştırılması ve karakterizasyonunu içerir.
Dersin İçeriği
Uygun laboratuar kitapçığı bulmak oldukça zordur. Bu yüzden, limitli bütçemize ve
donanımımıza uygun olası deneyleri içeren eksiksiz bir kitapçık tertip ettik. Buna karşın,
laboratuar müfredatı geliştirilmeye devam edilecektir.
Yapılan deneyler;
Bir Tamponun pKa’sı
Bir Amino Asidin Asit-Baz Davranışları
Spektrofotometrik Protein Analizleri
Pigmentlerin Tayini
Spektrofotometrik Karbohidrat Analizleri
Şekerlerin Kalitatif Analizi
Yağların Kalitatif Analizi
Vücut Sıvılarında Enzimlerin Tespiti
Hücresel Fraksiyonlama
Mikrozomların İzolasyonu
Proteinlerin Jel-Filtrasyon Kromatografisi
Proteinlerin İyon Değişim Kromatografisi
Proteinlerin SDS-PAGE Analizi
Glutatyon S-Transferaz’ların İzolasyonu
Page 5
Rat Karaciğer Glutatyon S-Transferaz’ların Karakterizasyonu
Dersin Değerlendirilmesi
Değerlendirme genellikle ders esnasında yazılı quizler (%25) ve raporlar (%25) ile devam
ederken ve dersin sonunda bir final sınavı (%50) olarak tasarlanmıştır.
Ön Koşul/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Materyali
• Lab Manual: Şen, A. (1999) Biochemistry Lab Manual (Prep.) Pamukkale University,
Faculty of Arts & Sciences, Biology Department, 51 pp.
BİYOLOJİK MATERYALLERİN TOPLANMASI VE SAKLANMASI
BİO 317
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 1. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Raşit URHAN (rurhan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersteki amaç, öğrencilere Protista, Fungi, Plantae ve Animalia alemlerine ait canlıların
nasıl toplandığını ve uzun süre muhafazasının nasıl olduğunu öğretmektir.
Ders İçeriği
• Canlıları toplama metotları ve malzemeleri
• Bitkileri toplama ve saklama metotları
• Önemli bitki örneklerinin toplanması ve kurutulması
• Hayvanları toplama ve saklama metotları
• Önemli hayvan örneklerinin toplanması ve saklanması
• Protista ve Fungi alemlerine ait örnekleri toplama ve saklama yöntemleri
• Bazı canlıların laboratuarda yetiştirilmesi ve bakımı
Page 6
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda, bir yazılı ara sınav (% 25), bir ödev değerlendirmesi (% 25), ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders notları
BİYOTEKNOLOJİ
B-319
3 ECTS Kredisi 3. yıl – 5. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler:2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Nazime MERCAN (nmercan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Öğrenciler, çevrede bulunan bir çok mikroorganizmanın olumlu fonksiyonlarını öğrenecekler,
ayrıca mikroorganizmaların endüstriyel uygulama alanlarını tartışacağız.
Dersin İçeriği
Bu ders içeriği şu ana konuları kapsamaktadır: Biyoteknolojinin önemi ve prensipleri,
mikrobiyal gelişim, biyokütle, biyoteknolojik prosesler, bitki hücre kültürü,
biotransformasyon, blotlar, konjugasyon, transduksiyon, plasmid DNA ve transpozon,
vektörler, çevre biyoteknolojisi (biyoparçalanabilir materyaller, biyofilms, biyogaz,
biyoomineralizasyon, biyopestisit, bioremedesyon, desülfürizasyon, vs.)
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda bir yazılı ara sınav (% 50), bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Tortora, G.J., Funke, B.R., Case, C.L. “Microbiology: an introduction”. Addison
Wesley Longman, Inc. 1998.
• Bains, W., “Biotechnology: From A to Z”, Oxford University Press, 1995.
• Arda, M., “Biyoteknoloji: Bazı Temel İlkeleri”, Kükem Derneği Bilimsel Yayınlar
No: 2, Ankara, 1994.
• Beyatlı, Y. “Biyoteknoloji ve Biyoprotein Üretimi”, Kükem Derneği Bilimsel
Yayınlar No: 5, Ankara, 1996.
Page 7
İMMÜNOLOJİ
B 321
3 ECTS Kredisi 3. yıl – 5. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler:2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Nazime MERCAN (nmercan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
İmmünite, yabancı organizmalar veya yabancı maddeler tarafından istila edilen konukçunun
savunma amacıyla spesifik olarak verdiği bir cevaptır. İmmunolojik faktörler, infeksiyöz ve
non-infeksiyöz hastalıkların ortaya çıkmasında primer ve sekonder etki olarak ortaya
çıkmaktadır. Bu nedenle, dersler boyunca öğrenciler immunolojinin temel prensiplerini
öğrenecekler.
Dersin İçeriği
Bu ders içeriği şu ana konuları kapsamaktadır: Giriş, immünite, immünite tipleri, antijen ve
antikorlar, B-hücre ve humoral immünite, T-hücre ve immünite, otoimmün hastalıklar,
diagnostic immunoloji (presipitasyon reaksiyonları, agglutinasyon reaksiyonları, fluorescent-
antikor teknikleri, ELİSA)
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı ara sınav (% 50), bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Özbal, Yusuf, “Temel İmmünoloji”, Nobel Tıp Kitabevleri Ltd. Şti., İstanbul, 2000.
• Kılıçturgay, K., “İmmünoloji”, Nobel Tıp Kitabevleri Ltd. Şti., İstanbul, 2003.
• Tortora, G.J., Funke, B.R., Case, C.L. “Microbiology: an introduction”. Addison
Wesley Longman, Inc. 1998.
LİMNOLOJİ
Bİ0 323
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 1. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat / hafta
Dersler: 2 saat / hafta
Türkçe
Öğretim üyeleri: Yrd. Doç. Dr. Mustafa DURAN
Dersin Amacı ve Hedefi
Page 8
Limnoloji hakkında temel bilgiler sunmak, akarsuların bazı temel özellikleri, göller, göletler,
ve diğer durgun sular ve suların sınıflaması gibi
Ders İçeriği
• Akarsuların bazı temel özellikleri
• Göllerin bazı temel özellikleri
• Göllerin sınıflandırılması
• Akarsuların ve göllerin ekolojik bölümleri
• Akuatik canlılara genel bir bakış
• Akarsu ekosisteminin sınıflandırılması
• Dağ suları
• Komunite ve onların çevreye adaptasyonları
Dersin Değerlendirmesi
Yazılı Vize : 2
Yazılı Final : 1
Önşart / Önerilen
Yok
Ders Kitabı / Diğer Materyal
• Brain Moss, “Ecology of Freshwaters” Blackwell Oxford. 1980
• Geoffrey Petts and Peter Calow “ river Biota” Blackwell Oxford. 1996
• Jülide Tanyolaç “Limnoloji” hatipoğlu Yayınevi, Ankara 1993.
TIBBİ BİTKİLER
BIO327
3 ECTS Kredisi 3. yıl- 1. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Ali ÇELİK (acelik@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bitkilerden sağıtımda yararlanmanın ilk dönemlerinden başlayarak günümüze değin geçirmiş
olduğu evrelerin belirlenmesi. Bu amaçla yararlanılan bitkiler, onların içerdikleri etken
maddeler ve bunların kullanım alanlarının tanıtılması.
Dersin İçeriği
Fitoterapi ve droglar. Bitkilerdeki etken maddeler ve bunların sınıflandırılması. Tıbbi
bitkilerin yetiştirilmesi, toplanması ve kullanımlarında dikkat edilmesi gereken noktalar.
Dünyada ve Türkiye’deki önemli tıbbi bitkiler ve bunların kullanım şekilleri.
Dersin Değerlendirilmesi
Page 9
Bir yarıyılda bir yazılı arasınav (% 50), bir yazılı yarıyılsonu sınavı (% 50) ve bir yazılı
laboratuvar sınavı (bu sınav, yazılı yarıyıl sonu sınavına girmek için ön şarttır) yapılmaktadır
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Baytop, T., “Türkiye’de Bitkiler ile Tedavi” Nobel Tıp Kitapevleri, ISBN: 975-4204-
021-1, (1999).
BESİN MİKROBİYOLOJİSİ
B 329
3 ECTS Kredisi 3. yıl – 5. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler:2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Nazime MERCAN (nmercan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Gıda mikrobiyolojisi, mikrobiyolojinin bir dalıdır. Bu dersin amacı, gıdalarda bulunan
mikroorganizmalar ve bunların rolleri hakkında bilgi vermektir. Ayrıca, aseptik paketleme ve
biyolojik stabilite öğrenilecektir.
Dersin İçeriği
Bu ders içeriği şu ana konuları kapsamaktadır: Gıdalardaki mikroorganizmalar, mezofilik
bakteriler, koliform grubu bakteriler ve E. coli, Salmonella, Staphylococcus aureus,
Clostridium perfringens, Listeria monocytogenes, Enterococcus, Bacillus cereus, Yersinia
enterecolitica, Vibrio parahaemolyticus, Aeromonas hydrophila, Clostridium botulinum,
Campylobacter jejuni, Shigella spp., Lipolitik bakteriler, proteolitik bakteriler, gıda kaynaklı
virüsler, biyolojik stabilite, gıda üretiminde mikroorganizmaların rolü.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı ara sınav (% 50), bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Halkman, K. ve ark., “Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları”, Sim Matbaacılık Ltd.
Şti., Ankara, 2000.
Page 10
BİYOKİMYASAL HESAPLAMALAR
BIO331
3 ECTS Kredisi
3. Sınıf - 1. Dönem
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
İrtibat: Alaattin SEN (sena@pamukkale.edu.tr)
URL: http://biyoloji.pamukkale.edu.tr/alaattin/index.htm
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu ders standart biyokimya derslerine ilave ve tamamlayıcı olarak tasarlanmıştır ve biyolojik
moleküllerin özellik ve davranışlarını anlamada basit matematiği kullanarak modern
biyokimyanın dengeli bir resmini sağlar. Biyokimyasal Hesaplamalar, 2. Baskı, ile öğrenciler
matematik problemlerini ele alma yeteneklerinde güven kazanacaklar ve biyokimyanın yapı
ve döngüleri ezberlemeden daha fazlası olduğunu keşfedeceklerdir.
Dersin İçeriği
Ders, aşağıdaki başlıkları ele alır:
• Sulu Solüsyonlar ve Asit Baz Kimyası
• Biyolojik Moleküllerin Kimyası
o Amino Asitler, Peptitler ve Proteinler
o Karbohidratlar
o Lipitler
• Biyokimyasal Enerjik
• Enzimler
• Spektrofotometre ve Diğer Optik Metotlar
• Biyokimyada İzotoplar
Örnek problemler tam anlamıyla adım adım bir şekilde çözülür.
Dersin Değerlendirilmesi
Öğretim ders anlatımlarını ve pratik problem çözüm saatlerini içerir. Dersin bir parçası olarak
öğrencilerden, bireysel veya grup olarak, küçük bir projeyi tamamlaması beklenir. Ders
periyodunda bir yazılı sınav (%25), bir proje (%25) ve dersin sonunda bir final sınavı (%50)
olarak tasarlanmıştır.
Ön Koşul/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Materyali
• Irwin H. Segel: Biochemical Calculations: How to Solve Mathematical Problems in
GeneralBiochemistry, 2nd Ed., 1996.
Page 11
DENİZ BİYOLOJİSİ
BIO333
3 ECTS Kredisi
3. yıl- 1. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyeleri: Yakup KASKA (caretta@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Deniz biyolojisinde araştırma yöntemleri, çeşitli özellikler yönünden denizlerin
sınıflandırılması, deniz organizmalarının ekolojik sınıflandırılmaları, denizlerin
biyocoğrafyası, bentik ve pelajik bölgelerin canlı toplulukları ve özelliklerinin tanıtılması.
Ders İçeriği
• Deniz biyolojisinin tarihsel gelişimi,
• Deniz biyolojisinde araştırma metodları
• Denizel ortamının sınıflandırılması,
• Denizdeki organizmaların tanıtılması ve ekolojik faktörlerin etkisi
• Biotik faktörler ve organizmalara etkileri
• Pelajik bölgenin canlı toplulukları
• Bentik bölgenin canlı toplulukları,
• Deniz sularının sınıflandırılması,
• Denizde organik madde oluşumu ve dolaşımı
• Denizlerde yaşayan canlıların sistematiği ve örnekler
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı ara sınav (%50), ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Geldiay, R., ve Kocataş, A. (1988). Deniz Biyolojisine Giriş. Ege Ünv. Fen Fakültesi
Kitaplar serisi:31. 459 sayfa, İzmir.
PALİNOLOJİ
BIO335
3 ECTS Kredisi
3. yıl – 1. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Ali ÇELİK (acelik@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Page 12
Bu dersin amacı öğrencilere polen oluşumu, yayılım şekilleri, polenlerin referans
preparatlarının hazırlanması, polen yakalama teknikleri, familyalarına göre polen tipleri,
polen teşhis yöntemleri hakkında bilgi sunmaktır.
Dersin İçeriği
Palinolojinin tanımı, tarihi, aerobiyolojisi. Polen yakalama teknikleri. Polen teşhis yöntemleri.
Palinoloji ve diğer bitki dalları arasındaki ilişkiler. Mikroskopta polen ve spor ölçümü.Polen
ve spor morfolojisi.NPC sınıflandırma. Değişik polen süslemeleri.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda bir yazılı arasınav (%50) ve bir yazılı yarıyılsonu sınavı (%50) yapılmaktadır
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Aytuğ, B., “Polen Morfolojisi ve Türkiye’nin Önemli Gynospermleri Üzerinde
Palinolojik Araştırmalar” İ.U. Orman Fak. Yay. No:114, İstanbul (1967)
• Faegri, K., Iversen, J. “Texbook of Polen analysis” Alden Press. London (1989)
• Pehlivan,
S.,”Türkiye’nin
Alerjen
Polenleri
Atlası”Gazi
Üniv.,Fen-
Ed.Fak.Ankara,(1995).
PARAZİTOLOJİ
BİO 337
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 1. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Raşit URHAN (rurhan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu derste, öğrencilere bir hücreli (protozoonlar) ve çok hücreli (helmintler ve
arthropodlar) parazitlerin neler olduğu, onların biyolojileri, epidemiyolojileri, sebep
olduğu hastalıklar, teşhislerinin nasıl yapıldığı, tedavileri ve korunma yollarının neler
olduğunun öğretilmesi amaçlanmaktadır.
Ders İçeriği
• Parazit ve parazitizm, parazit- konak ilişkileri, parazitliğin çeşitleri, parazitlerin
kaynakları ve bulaşması, parazitlerin konaklarına etki ve zararları, parazitlerin
teşhisi ve tedavisi.
• Parazitlerin sınıflandırılması, parazitik protozoonlar, helmintler ve arthropodlar,
türlerin sebep olduğu hastalıklar, epidemiyolojileri, hayat devreleri, teşhis ve
tedavileri, parazitlerden korunma.
Page 13
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda, bir yazılı ara sınav (% 25), bir ödev değerlendirmesi (% 25), ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders notları
• Göçmen, B., “Genel Parazitoloji (General Parasitology)”, Ege Üniversitesi, Fen
Fakültesi Kitaplar Serisi, No: 168, Bornova-Izmir, (2000).
POPULASYON GENETİĞİ
BIO339
3 ECTS Kredisi
3. yıl- 1. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyeleri: Yakup KASKA (caretta@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Popülasyonda genetik çeşitliliğin sebepleri ve bu çeşitliliğin araştırılması ve kullanılan
yöntemlerin tanıtılması amaçlanmıştır.
Ders İçeriği
• Gen havuzu ve allel frekansı,
• Hary-Weinberg Kuralı
• Doğal seçilim ve gen frekans değişimin nedenleri ve genetik sürüklenme,
• Populasyon izolasyon mekanizmaları, göç, mutasyon
• Ekolojik genetik ve türleşme
• Moleküler saat ve soyağacı, moleküler populasyon genetiği
• Gen havuzu ve nesli tükenmekte olan türler
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı ara sınav (%50), ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Hartl, D.L., ve Clark, A,G. (1989). Principles of Population genetics. Sinauer
Associates Inc., 670 pp. Massachusetts, USA.
Page 14
• Freeman, S., ve Herron, J.C./ (Çıplak ve Ark., Çeviri Editörleri) (2002). Evolutionary
Analysis-Evrimsel Analiz, Palme yayıncılık, 708 sayfa, Ankara.
• Demirsoy, A. (1988). Kalıtım ve Evrim. Meteksan yayıncılık, 902 sayfa, Ankara.
BİTKİ MORFOLOJİSİNE GİRİŞ
BIO 341
3 ECTS Kredisi
1.yıl 1.yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Yeşim KARA (eylul@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersin temel hedefi; bitki büyüme ve gelişmesinin temel kavram ve prensiplerinin
öğrenciye açık bir şekilde sunulmasıdır.
Ders İçeriği
Bitki hücresi, bitki hücre çeperinin yapısı, bitki hücresindeki organeller, vakuol, ergastik
maddeler, bitkisel dokular, meristem, parankima dokusu, koruyucu doku, kollenkima,
sklerenkima, iletim sistemi, salgı dokusu. Kökün morfolojisi ve anatomisi, gövdenin
morfolojisi ve anatomisi, yaprağın morfolojisi ve anatomisi, çiçeğin morfolojisi ve anatomisi,
çiçek durumları, çiçek formülü ve diyagramı, meyvenin yapısı ve çeşitleri, tohumun yapısı ve
çeşitleri.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda dönem içersinde 2 ara sınav ve dönem sonunda 1 final sınavı yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Başaran, D., Bitki Morfolojisi ve Anatomisi ders kitabı, Hatipoğlu Yayınları,
Diyarbakır, (1998).
• Yakar, N., Bitki Morfolojisine Giriş, İstanbul Üniversitesi Yayınları, (1983).
BOTANİKTE PREPERASYON TEKNİĞİ
BIO343
3 ECTS Kredisi
3. yıl – 1. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Ali ÇELİK (acelik@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Page 15
Bu dersin amacı canlı bitki örneklerin değişik kısımlarından farklı sılaytların nasıl
hazırlanacağına dair değişik bilgiler sunmak ve bitkilerin değişik kısımlarından alınan
slaytların tanınmasına dair öğrencileri bilgilendirmektir.
Dersin İçeriği
Bu ders aşağıdaki başlıkları içerir. Genel bilgiler, önemli araştırmalar, otopsi araştırmalar,
total preperasyon, sitolojik ve histolojil preperasyon teknikleri, fiksasyon ve fiksatifler,
yıkama, suyun uzaklaştırılması(dehidrasyon), temizleme, gömme, parçalara ayırma,
kesme(bıçaklar-mikrotomlar), parafinin uzaklaştırılması,boyama(boyalar, boyaların
sınıflandırılması, boyama mekanizmaları,boyaların kimyasal özellikleri,bitki dokularından
boya üretimi), stoplazmik yapıların boyanması, hücredeki makromoleküllerin gösterilmesi
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda bir yazılı arasınav (%50) ve bir yazılı yarıyılsonu sınavı (%50) yapılmaktadır
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Baker J.R., “Principles of Biological Microtechnique”, Methuen & Co Ltd. (1958)
• Clark G. (ed.), “Staining Procedures”, Published For The Biological Stain
Commission By Williams&Wilkins, 4.Baskı (1981)
• Ozban N., Özmutlu Ö., ”Mikropreparasyon Yöntemleri”, T.C. İst. Üni. Yayınları
(1991)
• Ruzin, S.E., “Plant Microtechnique and Microscopy”, Oxford Universitesi Basımı
(1999)
ÖZEL HİSTOLOJİ
3 ECTS Kredisi
3. yıl – 1. yarıyıl Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim üyesi: Nazan KESKIN (nkeskin@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Dersin amacı, yapı ve görev ilişkileri ile birlikte organ sistemlerinin histolojisinin
anlaşılmasıdır.
Dersin İçeriği
Sindirim, dolaşım, solunum, sinir, ürogenital, endokrin ve duyu organ sistemleri histolojisi
Page 16
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı arasınav, bir yazılı yarıyılsonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Temel Histoloji, Junqueira, L. C., J. Carneiro, Kelley R. O., Barış kitabevi, 1993.Özel
Histoloji, Karaöz E., SDÜ Yayınları, 2002.Histoloji, Paker S., Uludağ Üniversitesi
Basımevi, 1990.
• Cormack, D. H., “Ham 's Histology (9th Edition)”, J. B. Lippincott Co., Philadelphia,
1987.
• İnternet Kaynakları
SOSYAL BÖCEKLER
Bİ0 3--
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 1. yarıyıl
Lsans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim üyeleri: Yrd. Doç. Dr. Mustafa DURAN
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersin amacı ögrencilere geniş dağılım gösteren belli sosyal böcekler hakkında
bilgilendirmektir
Ders İçeriği
• Akraba seçilimi ve sosyal böcekler
• Termitlerde seksüel hiyararşi ve üreme strajileri
• Termitler
• Karıncalarda işçilerin düzenlenmesi ve kraliçe oluşumu
• Karıncalar
• Arılar
• Diğer sosyal böcekler
Dersin Değerlendirmesi
Yazılı Vize : 2
Yazılı Final : 1
Önşart / Önerilen
Yok
Ders Kitabı / Diğer Materyal
Page 17
• Freeman Scott and Herron Jon C. “Evolutionary Analysis” Prentice-Hall 2nd Ed. New
York 1999
• Engels W. 1990. Social Insects. Springer-Verlag Berlin
• Şahin R. Hayvanlarda Sosyal Davranışlar.
KORUMA BİYOLOJİSİ
BIO4…
3 ECTS Kredisi
4. yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyeleri: Yakup KASKA (caretta@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Ekosistem ve çeşitlerini tanıtarak buradaki madde döngülerini tanıtmaktır. Çevre kirliliğinin
sebepleri ve bunların önlenmesi ve doğayı korumanın önemini kavratmak, sürdürülebilir
kalkınmanın önemini vurgulamaktır.
Ders İçeriği
• Dünyanın Biyolojik çeşitliliğini tehdit eden faktörler: Asit yağmurları, şehirleşme, yol
yapımı, katı atıklar, iklim değişiklikileri ve global ısınma, ekonomik ve ekolojik
problemler,
• Doğa koruması için eğitim.
• Tehlikede olan, tehdit altında olan ve tehdit altında olmayan türler, Endemik türler ve
endemizmin korunması,
• Uluslar arası sözleşmeler ve bu sözleşmelerin Türkiyedeki uygulamaları,
• Gen bankaları, hayvanat bahçeleri, botanik parkları ve sulak alanlar. Tehlike sınırları
ve risk analizleri,
• Ekosistemlerin restorasyonu, yönetimi ve koruması,
• Sürdürülebilir kalkınma ve koruma stratejileri. Deniz kaplumbağaları, foklar,
kelaynaklar gibi türlerin korunmasının diğer türlerin korunmasına olan katkıları.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda bir yazılı ara sınav (%25), bir ödev değerlendirmesi (%25) ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (%50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Kocataş, A. (1999). Ekoloji-Çevre Biyolojisi. Ege Unv. Su Ürünleri Fak. Yayınları
No:51, 563 sayfa, İzmir.
• Şişli, N. (1999). Ekoloji-Çevre Bilim.Gazi Kitabevi, 492 sayfa, Ankara.
Page 18
• Cunningham, W.P. ve Saigo, B.W. (1995). Environmental Science. Wm. C. Brown
Publishers, 612 pp, Dubuque, USA.
FİKOLOJİ
BIO 3XX
3 ECTS Kredisi
3. yıl – 2. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta,
Türkçe
Öğretim Üyesi: Ali ÇELİK(acelik@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersin amacı öğrencilere denizlerde, tatlı ve acı sularda yaşayan alglerin morfolojik
yapıları, üremeleri, üreme tipleri, gelişme evreleri, ekolojileri, fizyolojileri içerisinde kültür
çalışmaları, beslenmeleri, ekonomik önemi olan algler ve onların kullanma alanları hakkında
bilgi vermektir.
Dersin İçeriği
Bu ders içeriği şu ana konuları kapsamaktadır: Alglerin Morfolojileri; Alglerin Üremeleri;
Alglerin Ekolojisi; Biyoindikatör Olarak Kullanılan Algler; Alglerin Fizyolojisi; Alg Kültürü;
Besleyici Tuzların Alglerdeki Önemi; Ekonomik Algler; Önemli Ekonomik Alg Ürünleri ve
Kullanım Alanları; Alglerin Fiziksel ve Kimyasal Yapıları; Alglerin Sistematiği.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yazılı arasınav (%50) ve bir yazılı yarıyılsonu sınavı (%50)
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Fritsch, F. E., "The structure and reproduction of the algae", Cambridge University
Press Cambrigde (1965)
• Lee, R.E., “ Phycology”, Cambridge University Press, Cambridge ( 1999)
• Fogg, G.E. and Thake, B., “Algal Cultures and Phytoplankton Ecology”, University of
Wisconsin Press; 3rd edition (1987)
• Van den Hoek, C., Mann, D. and Jahns, H.M.,“ Algae : An Introduction to
Phycology”, Cambridge University Press, (1996)
PALEOBOTANİK VE FİLOGENİ
BIO 3XX
Page 19
3 ECTS Kredi
3.yıl - 1.yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Ali ÇELİK (acelik@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Paleobotanik, fosil bitkiler yardımıyla yer tarihindeki biyo-fiziksel değişimleri ve bitki
grupları arasındaki filogenetik ilişkileri araştırmaktadır. Özelde filogeni belirli bir bitki
grubunun evrimi ise de, genel anlamda biyolojik evrimle ilgili sağlıklı değerlendirmeler
yapmaya olanak vermektedir. Diğer yandan bitkilerdeki yapı-işlev bağlantısı da, dersin
hedefleri arasındadır.
Dersin İçeriği
Bu ders içeriği şu ana konuları kapsamaktadır: Giriş, bitki fosillerinin aranması, hazırlanması,
yaşlarının belirlenmesi ve korunması; fosil bitkilerin adlandırılması; fosilleşme tipleri;
jeolojik zamandizin ve bitki yaşamı; sistematik paleobotanik; paleopalinoloji; paleoekoloji,
paleoklimatoloji ve arkeobotanik; bitkilerde büyük evrimsel olaylar ve filogeni; Türkiye’nin
fosil bitkileri ve özet.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda bir yazılı ara sınav (%50) ve bir yazılı yarı yıl sonu sınavı (%50) yapılmaktadır.
Ön şart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyel
• Kenrick, P. and Davis, P., “Fossil Plants”, Smithsonian Books, USA, (2004)
• Gemici, Y. Paleobotanik ve Filogeni Ders Notları, Üniversiteliler Ofset, 2003,
Bornova-İzmir.
• Willis, K. J. and McElwain, J. C. “The Evolution of Plants”, Oxford University Press,
UK, (2002)
• Agashe, S.N., “Paleobotany: Plants of the Past, Their Evolution, Paleoenvironment
and Application in Exploration of Fossil Fuels”, Science Publishers Inc; Rev Stdt
edition, USA, (1997)
HAYVAN FİZYOLOJİSİ
BIO302
3 ECTS Kredisi
3. yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyeleri: Yakup KASKA (caretta@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Page 20
Çeşitli hayvan gruplarına has başlıca sinir, kas, sindirim, duyu-denge, dolaşım, boşaltım ve
üreme sistemlerinin yapısı, görev ve fizyolojik işleyiş mekanizmalarının tanıtılması.
Ders İçeriği
• Fizyolojinin Tarif ve Alanı,
• Hayvanlarda Boşaltım;
• Sindirim Sistemi;
• Solunun Sistemi,
• Dolaşım Sistemi,
• Genital Sistem, Gamet Hücreleri Gonatlar, Omurgalılarda erkek ve dişi Üreme
Sisteminin Organları,
• Hareket Sistemi,
• Duyu organları sistem ve fizyolojisi
• Sinir Sistemi.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı ara sınav (%50), ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Noyan, A. (1993). Yaşamda ve Hekimlikte Fizyoloji. Meteksan Yayınları, 1157 sayfa,
Ankara.
• Aktümsek, A. (2001). Anatomi ve Fizyoloji, insan biyolojisi, Nobel yayınları, 504
sayfa, Ankara.
• Kaska, Y. (2003). Hayvan Fizyolojisi ders notları. 105 sayfa, Denizli.
BİYOKİMYA II
BIO306
5 ECTS Kredisi
3. Sınıf – 2. Dönem
Lisans
Zorunlu
3 saat/hafta
Dersler: 3 saat/hafta
Türkçe
İrtibat: Alaattin SEN (sena@pamukkale.edu.tr)
URL: http://biyoloji.pamukkale.edu.tr/alaattin/index.htm
Dersin Amacı ve Hedefi
İki dönemlik serinin ikinci dönemi, modern biyokimyanın prensiplerine eksiksiz bir giriş
sağlamaktadır. Bu dersin ana hedefi öğrencilere biyokimyanın prensiplerini ve temel
konseptlerini vermektir.
Dersin İçeriği
Page 21
İkinci dönem çoğunlukla biyolojik bileşiklerin hücresel metabolizmasını; biyolojik
oksidasyonu; kimyasal bağlanma, fosforilasyon, ATP ve NADPH döngüleri; karbohidrat ve
lipit metabolizmasına giriş, azot ve üre döngüleri, amino asit ve nükleotit metabolizması ve
fotosentezi içerir.
Dersin Değerlendirilmesi
Değerlendirme genellikle ders esnasında devam eder (toplam %25), ders periyodunda bir
yazılı sınav (%25) ve ders sonunda bir final sınavı (%50) olarak tasarlanmıştır.
Ön Koşul/Önerilen
Biyokimya I
Ders Kitabı/Materyali
• D. L. Nelson & M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry 4th Ed, W.H.
Freeman and Co., 2005.
• C. K. Mathews, K. E.. van Holde & K. G. Ahern: Biochemistry 3rd Ed.,
Benjamin/Cummings, 2000.
GENETİK-II
BIO 310
3 ECTS Kredisi
3. Yıl – II. Dönem
Zorunlu
3 saat/hafta
Dersler: 3 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Fevziye CELEBİ TOPRAK (fctoprak@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Moleküler genetik alanında çalışmak biyoloji ve tıp alanında heyecan verici ve çok hızlı bir
gelişme gösteren alandır. Kurs sırasında öğrenciler moleküler genetiğinin temelini
öğreneceklerdir. Ayrıca genler arası ilişki, gen yapısı, ve çekirdek dışı kalıtım.Ayrıca
rekombinant DNA teknolojisi konularıda tartışılacak. Bu dersi alan öğrenciler moleküler
genetik problemleri ile karşılaştıklarında bunlara nasıl bir çözüm getireceklerini kolaylıkla
bulabilmeleridir.
Dersin İçeriği
DNA’nın yapısı: DNA genetik materyal, DNA’nın yapısı, ve DNA’nın replikasyon
mekanizması, ökaryotlarda DNA replikasyonu, DNA ve gen.
DNA’nın fonksiyonu::Transkripsiyon, translasyon, genetik kod, protein sentezi, genetik kodun
üniversal oluşu, ökaryot RNA’sı ve gen splising mekanizması.
Genlerin Düzenlenmesi:Prokaryotlarda genlerin düzenlenmesi Lac operon, keşfedilmesi
(pozitif ve negatif kontrol) ve problem çözümleri..
Page 22
Bakterileri ve onların virüslerinde rekombinasyon:Bakterilerde transfer mekanizmaları:
bakterial konjugasyon, bakterial rekombinasyon ve E. coli ‘de kromozom
haritalamaları.bakterial transformasyon, bakteriofaj genetiği, trandüksüyon, kromozom
haritalaması ve bakterial gen transfer edilmesi.
Çekirdek Dışı kalıtımr:yüksek bitkilerde çekirdek dışı kalıtım, mantarlarda çekirdek dışı
kalıtım, salyangozlarda, Chlamydomonas’da çekirdek dışı genler, mitokondri genomu
vekloroplast genomu.
Dersin Değerlendirirlmesi
Bir yarıyılda 2 yazılı ara sınav, quizler (%50) ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50)
yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyaller
• Griffiths, A. J. F., Miller, J. H., Suzuki, D.T., Lewontin, R. C., Gelbart, W. M. ‘’An
Introduction to Genetic Analysis’’, 6. Edition. W.H. Freeman and Company New
York, (1996)
• Hartwell, L. H., Hood, L., Goldberg, M.L., Reynolds, A.E., Silver, L.M., Veres, R.C.,
‘’Genetics From Genes to Genoms’’, Mc Graw Hill, (2000)
• Klug, W.S., Cummings, M.R., ‘’Genetik Kavramlar’’ Çeviri Editörü Prof. Dr. Cihan
Öner. Palme Yayıncılık, (2002)
• Çeşitli internet kaynakları
HAYVAN FİZYOLOJİSİ LABORATUARI
Bİ0 304
2 ECTS Kredi
3.yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim üyeleri: Yrd. Doç. Dr. Mustafa DURAN
Dersin Amacı ve Hedefi
Hayvan fizyoloji deneylerinin temel bilgi ve ana prensiplerini sunmaktır
Ders İçeriği
• Hücrede aktif ve pasif taşıma
• Memran fizyolojisi
• Ökaryot hücre zarının fizyolojik özellikleri
• refleks
• Kurbağada çeşitli kas ve spinal refleks deneyleri
• Kasın çalışma düzeni
• Kas yorgunluğu
• Duyu sistemleri
Page 23
• Kan gruplarının belirlenmesi
• Kan hücre sayımı
Dersin Değerlendirmesi
Yazılı Vize : 2
Yazılı Final : 1
Önşart / Önerilen
Yok
Ders Kitabı / Diğer Materyal
• Lab. kitabı
ICHTIOLOGY
Bİ0 318
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim üyeleri: Yrd. Doç. Dr. Mustafa DURAN
Dersin Amacı ve Hedefi
Balıklar hakkındaki konularda detaylı bilgi vermek
Ders İçeriği
• Balıkların sınıflandırılması
• Balık morfolojisi
• Deri
• İskelet sistemi
• Kas ve hareket sistemi
• Solungaç ve hava kesesi
• Dolaşım ve kan
• Ozmotik düzenleme ve boşaltım
• Üreme
• Sinir ve hormon sistemleri
• Yiyecek, sindirim, besin ve büyüme
• Ekoloji ve zoocografya
Dersin Değerlendirmesi
Yazılı Vize : 2
Yazılı Final : 1
Önşart / Önerilen
Page 24
Yok
Ders Kitabı / Diğer Materyal
• Ali Demirsoy “ yaşamım temel kuralları – Omurgalılar” Meteksan. Ankara. 1988
• Remzi Geldiay ve Süleyman Balık “Türkiye Tatlısu Balıkları” Ege Üniv. Basımevi.
İzmir 1999
KANSER BİYOLOJİSİ
BIO 320
3 ECTS Kredisi 4. yıl - 2. yarıyıl Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim üyesi: Hakan AKÇA (hakca@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu derste öğrencilerin normal hücreden malignant hücreye dönüşüm, Kanser hücrelerinin
konak doku içine yayılmaları ile kanser hücrelerinin konak organizmaya metastatik
yayılımlarının hücresel ve moleküler mekanizmalarını öğrenmeleri planlanmıştır. Öğrenciler
aynı zamanda kanser hastalarındaki ya da deney hayvanlarındaki tümör dokularında meydana
gelen önemli pathofizyolojik değişiklikleri de öğreneceklerdir.
Ders İçeriği
Kanserin Karakteristik Özellikleri: Malignant hastalıkların özellikleri, İnsan kanserinin
sınıflandırılması.
Kanserin Epidemiyolojisi: Kanser oranı ve ölüm sıklığı, İnsan kanserlerinin coğrafik
dağılımı, Çeşitli faktörlerin kanser oluşumundaki rolü, kansere sebep olan genetik faktörler.
Kanser Hücrelerindeki Genetik farklılıklar: Kromozomal anormallikler, Çeşitli kanser
tiplerindeki genetik değişiklikler, Kromozomun biyolojik aktivitesi, Transkripsiyon faktörleri,
Transkripsiyon sonrası kontrol, Büyüme ve farklılaşma faktörleri.
Kansere Neden Olan Etmenler: Kimyasal karsinojenler, kimyasal karsinojenlerin metabolic
aktivasyonu, Kimyasal karsinojenlerin onkogenler ve tümör baskılayıcı genlerle ilişkisi.
Onkogenler: Provirus, protovirus ve onkogen hipotezi, Onkogen aileleri, Onkogenlerin hücre
farklılaştırma yetenekleri.
Tümör Baskılayıcı Genler: RB, p53, Wilms’ tümör baskılayıcı gen wt-1, Deleted in
colorectal cancer (DCC) gene, Hereditary nonpolyposis colorectal cancer (HNPCC) gene,
Neurofibromatosis genes NF-1 and NF_2, renal cell carcinoma gene.
Hücre Döngüsünün Düzenlenmesi ve Apoptosis: Hücre döngüsünün kontrolü, siklin bağımlı
protein kinazlar, siklinler, Hücre döngüsünün kontrol noktaları, Apoptosis.
Page 25
Tümör Metastazının Biyolojisi: İnvazyon ve Metastaz, Metastatik Tümör hücrelerinin
biyokimyasal özellikleri, Kanser hücre migrasyonunda rol oynayan kemotaktik faktörler,
Onkogenlerin metastazdaki rolü.
Tümör İmmunolojisi: Kansere karşı oluşan immun yanıt mekanizmaları
Dersin Değerlendirilmesi
İki yazılı arasınav (%50) ve dönem sonu bir final sınavı (%50).
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter
Walter , Molecular Biology of The Cell fourth edition Garland Science; 4th Bk&Cdr
edition (March, 2002).
• Matthew P Scott, Paul Matsudaira, Harvey Lodish, James Darnell, Lawrence
Zipursky, Chris A Kaiser, Arnold Berk, Monty Krieger, Molecular Cell Biology, Fifth
Edition, by , W. H. Freeman; 5th edition (August 1, 2003)
• Roger J King Cancer Biology, Second Edition, Prentice Hall; 2 edition, 2000
• Recent research Articles on Cancer Biology
• İnternet kaynakları
KARŞILAŞTIRMALI OMURGALILAR ANATAMİSİ
Bİ0 322
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 2. yarıyıl
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim üyeleri: Yrd. Doç. Dr. Mustafa DURAN
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersin amacı omurgalıların açıklamalı ve fonksiyonel morfolojileri, ontogeni ve
filogenileri hakkında bilgi vermektir
Ders İçeriği
• Omurgalı hayvanların sınıflandırılması ve evrimleri
• Omurgalıların genel karakterleri
• Deri ve türevleri
• İskelet, kas, sindirim, solunum, boşaltım, üreme, dolaşım, sinir sistemleri
• Sistemlerin omurgalı hayvanlarda karşılaştırılması
Dersin Değerlendirmesi
Yazılı Vize : 2
Page 26
Yazılı Final : 1
Önşart / Önerilen
Yok
Ders Kitabı / Diğer Materyal
• Melekper Öktay “Omurgalı Hayvanların Karşılaştırmalı Anatomisi” İ.Ü. Fen Fak.
Basımevi. İstanbul 1988
VEJETASYON BİLİMİ
BIO328
3 ECTS Kredisi
4. yıl – 2. yarıyıl Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Ali ÇELİK (acelik@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu derste bitki topluluklarının yapısı, analizi, sınıflandırılmaları, gelişimleri ve ortamla olan
ilişkilerinin kavratılması amaçlanmıştır.
Dersin İçeriği
Bitki komunitelerinin yapısı, vejetasyonun oluşumu ve gelişmesi,vejetasyonu inceleme
yöntemleri, vejetasyonun kantitatif ve kalitatif özellikleri. Bitki süksasyonu. Vejetasyonun
sınıflandırılması.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda bir yazılı arasınav (%50) ve bir yazılı yarıyılsonu sınavı (%50) yapılmaktadır
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Seçmen, Ö., “Vejetasyon Bilgisi Ders Notları”. Ege Üniv., Fen Fak., (1992)
• Akman, Y., Ketenoğlu, O., Geven, F., “Vejetasyon Ekolojisi ve araştırma Metodları”
Ankara Üniv., Fen Fak. (ISBN: 975-97436-1-2), (2001)
BİTKİ DOKU KÜLTÜRÜ
BIO 332
3 ECTS Kredisi
1.yıl 2.yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Yeşim KARA (eylul@pamukkale.edu.tr)
Page 27
Dersin Amacı ve Büyümesi
Bu dersin temel hedefi; bitki dokularının embriyonal durumdan özel kültür ortamlarında
yetiştirilmesi şartlarını anlatmaktır.
Ders İçeriği
Hücre kültüründe temel prensipler, ökaryotik hücre yapı ve özellikleri, doku kültürünün
kullanım alanları, avantajları ve sorunları, süspansiyon ve stationer kültürler, hücrelerin
kültürde davranışları, doku kültür laboratuar şartları, cihazları, cam ve dispozibl malzemeler,
kültürde hücrenin ihtiyaçları, vasat içerikleri ve hazırlanması, kültürlerin saklanma ve taşınma
koşulları, primer hücre kültürü hazırlanması ve subkültür yapımı.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda dönem içersinde 2 ara sınav ve dönem sonunda 1 final sınavı yapılmaktadır.
%50-%50 olarak değerlendirilmektedir.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Başaran, D., Bitki Doku Kültürü ders kitabı, DİYARBAKIR, (1998).
• Kocaçalışkan, I., Bitki Kültürleri, Dumlupınar Üniversitesi, KÜTAHYA, (2003).
HAYVAN TOKSİNLERİ
BİO 334
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Raşit URHAN (rurhan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersteki amaç, öğrencilere hayvanların savunmak ve avlanmak için kullandıkları zehirleri
ve canlılara olan etkilerini öğretmektir.
Ders İçeriği
• Hayvanlar aleminde genellikle korunma, saldırma ve avlanma amacı ile kullanılan
çeşitli zehirli maddelerin tanımları,
• Hayvan toksinlerinin etki mekanizmaları
• Hayvan toksinlerinin içerikleri,
• Toksin üreten hayvan çeşitleri
• Toksinlerin canlılara yaptığı letal veya subletal etkiler
• Türkiye’de yayılış gösteren toksik hayvanlar
Page 28
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda, bir yazılı ara sınav (% 25), bir ödev değerlendirmesi (% 25), ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders notları
HERBARYUM TEKNİĞİ
BIO336
3 ECTS Kredisi 3. yıl – 2. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Ali ÇELİK (acelik@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu derste çeşitli bitki gruplarının herbaryumlarının nasıl yapıldığı, bu örneklerin saklanması,
korunması konusunda bilgilerin verilmesi amaçlanmaktadır.
Dersin İçeriği
Herbaryumun tarihçesi, dünya ve yurdumuzdaki herbaryumlar, çiçekli bitkiler, algler,
karayosunları ve eğreltilerin herbaryumu, mantarlar gibi bazı özel grupların herbaryumları.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda bir yazılı arasınav (% 40) ve bir yazılı yarıyılsonu sınavı (% 60) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders Notu
MEMBRAN BİYOLOJİSİ
BIO 338
3 ECTS Kredisi 3. yıl – 2. yarıyıl Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Page 29
Öğretim üyesi: Nazan KESKIN (nkeskin@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Ders biyolojik membranların yapı ve görevlerini içermektedir.
Dersin İçeriği
Membranların yapısal bileşenleri ve organizasyonu; hücre yüzeyi özellikleri
;
membran
transport mekanizmaları; membran potansiyeli; hücre- hücre tanıma olayları; salgı yolunda
membran trafiği; proteinlerin membranlara hedeflenmesi ve translokasyonu; sinyal iletimi;
membranlarda sitoiskelet ve ekstrasellüler bağlantılar
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı arasınav, bir yazılı yarıyılsonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Molecular Cell Biology, James Darnell, Harvey Lodish and David Baltimore, second
edition, Scientific American Books, 1990.
• Biological membranes, Their Structure and Function, Roger Harrison and George G.
Lunt, Second Edition, 1980.
ÜREME BİYOLOJİSİ
BİO324
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Raşit URHAN (rurhan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersteki amaç, öğrencilere canlılardaki üreme sistemi hakkında bilgi vererek, hayvanlarda
ve insan da üreme sistemini öğretmektir.
Ders İçeriği
• Üreme, eşeyli ve eşeysiz üreme
• Hayvanlarda üreme
• Döllenme
• Eşleşme ve eşeysel faaliyetler
• Gonadlar ve gonadların gelişmesi
Page 30
• İnsan üreme sistemleri (dişi ve erkek)
• Embriyo ve beslenmesi
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda, bir yazılı ara sınav (% 25), bir ödev değerlendirmesi (% 25), ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders notları
EKOFİZYOLOJİ
BIO3…
3 ECTS Kredisi
3. yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Seçmeli
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyeleri: Yakup KASKA (caretta@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Ekosistemler ve madde döngülerini tanıtarak biotik ve abiyotik faktörlerin bitki ve hayvan
fizyolojilerine etkilerini tanıtarak çevre kirliliği ve bunların canlılara olan etkilerine
değinilecektir.
Ders İçeriği
• Ekosistemler, madde döngüsü ve enerji akışı
• Homeostasi
• Canlıların çevresi ve etkileşimler
• Toprağın calılara etkisi
• Suyun canlılara etkisi
• Işığın canlılara etkisi
• Sıcaklığın canlılara etkisi
• Çevre kirliliği ve biyoakümülasyon
• Ekofizyoloji ve uygulamalı çalışma alanları
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda iki yazılı ara sınav (%50), ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Page 31
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Kocataş, A. (1999). Ekoloji-Çevre Biyolojisi. Ege Unv. Su Ürünleri Fak. Yayınları
No:51, 563 sayfa, İzmir.
• Şişli, N. (1999). Ekoloji-Çevre Bilim.Gazi Kitabevi, 492 sayfa, Ankara.
• Cunningham, W.P. ve Saigo, B.W. (1995). Environmental Science. Wm. C. Brown
Publishers, 612 pp, Dubuque, USA.
• Kaska Y.-Ders notları
ORNİTOLOJİ
BİO 3XX
3 ECTS Kredisi
3.yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Raşit URHAN (rurhan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu derste, öğrencilere kuşların genel özellikleri hakkında bilgi vermek ve Türkiye’de
gözlenebilen kuş türlerini tanıtmaktır.
Ders İçeriği
• Kuşların genel özellikleri, vücut yapıları, deri ve deri oluşumları, ekstremiteler,
gaga ve çeşitleri, tüylerin yapısı ve tüy değişimi, beslenme, yuvaları,
yumurtaları, duyu organları ve organ sistemleri.
• Kuşların dağılışı ve göç yolları.
• Kuşların sınıflandırılması,
• Ülkemizde görülebilen kuş türleri.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda, bir yazılı ara sınav (% 25), bir ödev değerlendirmesi (% 25), ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders notları
ZOOLOJİK MÜZE METOTLARI
BİO 4XX
3 ECTS Kredisi
4.yıl- 2. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Page 32
Öğretim Üyesi: Raşit URHAN (rurhan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersteki amaç, öğrencilere omurgalı ve omurgasız hayvanları toplama ve saklama
yöntemlerini öğretmektir.
Ders İçeriği
• Müzeciliğin tarihçesi, Müzeolojinin ana konuları
• Hayvanları toplama ve saklama metotlar
• Memeli hayvanları, kuşları ve sürüngenleri yakalama, öldürme ve fiksasyon metotları
• Kurbağaları ve balıkları yakalama, öldürme ve fiksasyon metotları
• Omurgasız hayvanları yakalama, öldürme ve fiksasyon metotları
• Müze materyallerinin bakımı
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda, bir yazılı ara sınav (% 25), bir ödev değerlendirmesi (% 25), ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders notları
BİYOLOJİK MÜCADELE
BİO 4XX
3 ECTS Kredisi
4.yıl- 1. yarıyıl
Lisans
Zorunlu
2 saat/hafta
Dersler: 2 saat/hafta
Türkçe
Öğretim Üyesi: Raşit URHAN (rurhan@pamukkale.edu.tr)
Dersin Amacı ve Hedefi
Bu dersteki amaç, öğrencilere biyolojik mücadelenin önemini ve Türkiye’deki
uygulamalarını öğretmektir.
Ders İçeriği
• Biyolojik mücadele, önemi, özellikleri,
• Biyolojik mücadelenin tarihi gelişimi ve temel esasları,
• Biyolojik mücadelede kullanılan organizmalar,
• Türkiye’deki biyolojik mücadele uygulamaları ve biyoteknolojik metodlar
• Türkiye’de ki önemli doğal ve yaygın zararlılar ve doğal düşmanları.
Dersin Değerlendirilmesi
Bir yarıyılda, bir yazılı ara sınav (% 25), bir ödev değerlendirmesi (% 25), ve bir yazılı yarıyıl
sonu sınavı (% 50) yapılmaktadır.
Önşart/Önerilen
Yok
Ders Kitabı/Diğer Materyal
• Ders notları

23 Şubat 2009 Pazartesi

Transkripsiyon

Transkripsiyon

Transkripsiyon-Replikasyon Farkları
1.Replikasyon sırasında tüm kromozom kopyalanır fakat transkripsiyonda sadece bir gen bölgesi kopyalanabilir.
2. Transkripsiyon düzeyi organizmanın o andaki protein ihtiyacına bağlı olarak değişir. Her dokuda aynı anda
farklı genlerin transkripsiyonu olur.
3. Transkripsiyon replikasyonda olduğu gibi bir primer’e ihtiyaç duymaz. Transkripsiyon için sadece bir DNA
zinciri kalıp olarak iş görür.
4. DNA segmentinin başı ve sonunu belirleyen spesifik düzenleyici dizeler hangi DNA segmentinin şablon olarak
kullanılacağını gösterir.
5.RNA polimerazın proofreading aktivitesi yoktur.

RNA Çeşitleri

tRNA -
küçük, 80 nt uzunluğunda, antikodon sekansı
içeren, single strand ve ikincil katlanmalar geçirmiş bir
moleküldür. mRNA’daki bilgileri okur ve uygun amino asidleri
ribozoma taşır.
rRNA -
ribozomların yapısal bileşenidir.
mRNA- bir gen veya gen seti ile bir veya daha fazla
polipeptidin
amino asid dizisini kodlar.
hnRNA- ökaryotlarda olgunlaşmamış öncül mRNA (pre-mRNA)
molekülüdür.
small nuclear RNA (snRNP's)- spliceosome oluşumunda yapısal
ve katalitik rol oynar. 5 snRNP's spliceosome yapıısna katılır.
[U1, U2, U4, U5, & U6];
SRP (signal recognition particle)- scRNA, ER’a hedeflenmeyi
sağlayan protein-RNA kompleksinin bileşenidir ve
polipeptitteki sinyal dizilim ile belirlenir.
micro RNA's (micro-RNA)- antisense RNA & interfereing RNA
olarak da adlandırılır. mRNA bağlanarak inaktive eden 20-24
nt uzunluğundaki kısa RNA molekülleridir.Gen ekspresyonunu
regüle eder.

Prokaryotik- Ökaryotik RNA polimeraz enzimler
Prokaryotlarda,
RNA polimeraz kompleks tek bir enzimdir. Kompleks α2ββ´ω ve promotor bölgesini tanıyan σ subünitesinden
oluşur.
Enzimin aktif formuna holoenzim denir.β ve β katalitik bölgelerdir ve transkripsiyon için aktif merkezi oluştururlar.
Ökaryotlarda,3 farklı tiptedir: RNA polimeraz I, II, III
RNA polimeraz I (Pol I) tek tip RNA sentezinden (preribozomal RNA) sorumludur. Bu RNA 18 S, 5.8 S ve 28 S
rRNA’lar için prekürsördür.
RNA polimeraz II (Pol II)’nin temel fonksiyonu mRNA ve bazı spesifik RNA’ların sentezidir.Bu enzim binlerce farklı
RNA bölgesini tanıyabilir.
RNA polimeraz III (Pol III); tRNA, 5 S rRNA ve bazı küçük özel RNA’ları sentezler.
Transkripsiyon için temel gereksinimler ?
RNA polimeraz enzimi
DNA kalıbı (sadece bir DNA zinciri kalıp olarak iş görür, replikasyonda her iki zincirin tam kopyası çıkarılıyordu!!!!! )
NTP (ATP, GTP, UTP ve CTP) (dNTP değil !!!)
Mg2+ ihtiyaç vardır.
RNA polimerazlar transkripsiyona başlayacağı gen bölgesini nasıl tanır ?
Promotor, RNA polimerazın transkripsiyonu başlatmak üzere DNA’ya bağlandığı özel bölgelerdir.
Bakteriyel promotorlarda -10 (5) TATAAT ve -35 (5) TTGACA olmak üzere iki konsensus dizi bulunmuştur. Üçüncü bir AT’den
zengin bölge UP (upstream promotor) olarak adlandırılır ve birçok genin -40 ve -60 bölgesindedir. Promotorlardaki, konsensüs
diziler türler arasında korunmuştur (tamamen aynı değildir)
RNA polimeraz’ın 3 5 proofreading aktivitesi
yoktur. 1/10
4
-10
5
ribonükleotid hata oranı
vardır. RNA hücre içinde geçici olarak sentez
edildiğinden hatanın kalıcı etkisi yoktur.

Prokaryotik promotor

Ökaryotik promotorda, transkripsiyon başlangıcından sonraki,-25 bç; örn “TATA Box ve-50 -200
bç ilerideki . “Cat Box” = CAAT ve “GC Box” GGGCGG dizilimleri yer alır.

Prokaryotik Transkripsiyonun Basamakları

Ökaryotik promotor

I- Initiation- başlama-
Kalıba
bağlanma, RNA polimerazın
sigma alt birimi ile DNA’nın
özgül
promotor
dizisine
bağlanması
ile
gerçekleşir.
Transkripsiyon için bir “buble”
gereklidir.
Bu E. coli’de 17
baz çifti uzunluğundadır.
II-
Elongation-uzama:
8-9

uzunluğunda RNA sentezlendikten sonra
sigma
faktörü
RNA
polimerazın
yapısından ayrılır.
E. coli’de zincir
uzama hızı 50-90 nükleotid/saniye’dir.
DNA sarmalı hızlı şekilde çözülür ve
enzim bölgedeki sentezi tamamlayınca
hemen eski sarmal haline çevrilir. Yeni
RNA zinciri kısmı olarak DNA-RNA
hibridi şeklindedir, fakat büyük kısmı tek
zincirli serbest formdadır.
Termination-sonlanma: Prokaryotlarda
terminasyon dizileri iki tiptir: ρ faktörü bağımlı
ve (ρ-independent)
Tip I (ρ-independent): Palindromik, inverse
repeat dizilerinin oluşturduğu hairpin loop yapısı
ile DNA-RNA hibridi kararsız hale gelir ve
sentez sonlandırılır
Tip II ρ faktörü bağımlı- DNA kalıbı ve RNA
Ökaryotik Transkripsiyon ve Farkları
Ökaryotlarda transkripsiyon çekirdekte, translasyon sitoplazmada birbirinden tamamen ayrılmış olarak
gerçekleşir.
Transkripsiyonda 3 farklı RNA pol enzimi görev alır. RNA polimeraz II mRNA transkripsiyonunu yapan
enzimdir.
Promotorlara ek olarak genin 5’ kontrol bölgesinin dışında genin içinde ve 3’ aşağı bölgesinde de yer alabilen
enhensır (Trans-acting faktörler) olarak bilinen diziler bulunur. Prokaryotlarda olduğu gibi, promotorda, iki
tip dizi ihtiyacı vardır
1. Bazal elementler (transkripsiyon başlangıcından sonraki,-25 bç; örn “TATA Box” = TATAAAA) *AT-rich
DNA
2. Proximal elementler (upstream,-50 to -200 bç, . “Cat Box” = CAAT and “GC Box” GGGCGG)
Sentezlenen ilk RNA kopyası, olgun ökaryotik mRNA ya dönüşmek için bir dizi işlenme basamağından geçer.
Bu nedenle Transkripsiyon ve translasyon birarada olmaz.
Ökaryotik mRNA’lar monosistroniktir.
Prokaryotik mRNA’lar
mRNA modifikasyona uğratılmadan translasyonda kullanılır. Prokaryotlar nucleus
içermediğinden, mRNA transkripsiyon tamamlanmadan ribozomlara bağlanarak aynı anda translasyona da katılır.
Prokaryotlarda mRNA’lar polisistronik yapıdadır.
Ökaryotlarda mRNA’nın şlenmesi
Sentezlenen mRNA pre-mRNA formundadır. şlenme basamakları
1. mRNA’nın 5’ ucuna şapka (cap) yapısı takılır.
20-30 nt mRNA sentezinden sonra, mRNA’nın 5’- ucuna 7-metilguanozin 5->5 trifosfat bağı ile eklenir. Bu
yapı mRNA’nın ribozomlara bağlanması için esastır.
2. mRNA’nın 3’ ucuna poli A kuyruğu (50-250 A nt) eklenir. Bu yapı transkripsiyon sonlanması ve mRNA
kararlılığı için esastır.

3. Eğer mRNA split gen formunda ise yani intron (kodlayıcı olmayan sekanslar) içeriyorsa,
Okaryotik pre-mRNA’lar genellikle intron içerirler (ve bazı virüsler)
intron = ekzon bölgeleri arasında kalan non-coding DNA dizileri, exon = a.a kodlayan DNA dizileridir.

Öncül mRNA yapısındaki proteine dönüşmeyecek bölgeler (intronlar) çıkartılarak proteine dönüşecek
bölgeler (eksonlar) birleştirilir. Bu işleme sıplaysing (splicing) denir.
Tüm intronlar 5’-GT(U) dizisi ile başlar ve AG-3’ dizisi ile biter.(Splicing için anahtar dizi) Splicing mekanizmasında
gerçekleşen işlemler;
C- Spliceosome kompleksi ile exonların birleştirilmesi-
Küçük snRNP (nükleer ribonükleoproteinler) tarafından
yürütülen bir mekanizmadır.
B-Grup II intronlarda splicing (eklenme) mekanizması
A-Grup I intronlarda splicing (eklenme) mekanizması
RNA-DNA hibridizasyonu ile tavuk ovalbumin genindeki kodlayıcı olmayan dizelerin gösterilmesi

RNA polimerazın inhibisyonu

Aktinomisin D: Antibiyotik olarak kullanılır Bakteri ve ökaryotlarda G=C baz çiftleri arasına girerek DNA
yapısını bozar.

Rifampisin: Bakteriyel RNA sentezini RNA polimerazın β subünitesine bağlanarak inhibe eder.

Α-amanitin: Pol II’yi yüksek dozlarda inhibe eder. Pol I üzerine etkisi yoktur.
Post-transkripsiyonel modifikasyon, mRNA
editing:
1. pre-RNA’daki nükleotidlere ekleme –
çıkarma yada yapıdaki bazların kimyasal
değişikliğe uğratılmasıyla (böylece
mRNA’daki bazlar ilgili DNA sekansı ile
tam komplemeterlik göstermez)
2. Amino asitlerin değişikliği, ekleme yada
çıkarılmasıyla gerçekleştirilir.
RNA editing, genellikle hücre yada dokuya
spesifiktir. (Örn. protozoa, slime molds, bitki
organelleri, memeliler)
Hücresel mRNA’lar farklı hızlarda yıkılırlar
Vertebralı hücresinde ortalama mRNA
yarı ömrü yaklaşık 3 saattir.
Ökaryotik hücrelerde poli (A) birçok
mRNA’nın stabilitesi için önemlidir.
Bakteriyel mRNA’nın yarı ömrü ise
yaklaşık 1.5 dakika’dır.
⇒ RNA ribonükleazlar ile yıkılır
(genellikle 5 3 yönünde).
Laboratuvarda polinükleotid fosforilaz
enzimi sentetik RNA polimerleri
yapımında kullanılır.
Ribozomal RNA ve tRNA’lar da şlenirler

Hem prokaryotik hem de ökaryotik hücrelerde
ribozomal DNA’lar daha uzun olan
preribozomal RNA’lardan oluşurlar. Birçok
hücre 40-50 farklı tRNA içerir ve ökaryotik
hücreler birçok tRNA geninin çoklu ve intron
içeren kopyalarını içermektedir.

RNAase D ve RNAase P bu intronların
çıkarılmasında görev alan enzimlerdir.
RNAase P’nin hem RNA hem de protein
komponenti bulunur.